鲤在低温胁迫下肝胰腺转录组测序分析

• 作者: 乔志刚 刘思嘉 张存芳 田菲 赵凯
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 鲤 低温耐受 肝胰腺 转录组测序 糖酵解/糖质新生途径
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 168-178
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0503

摘要

检测低温耐受与低温敏感鲤品种低温胁迫下的差异表达基因,探究鲤低温适应的分子应答过程.低温胁迫后对松浦镜鲤及荷包红鲤肝胰腺进行转录组测序,并对表达差异基因进行功能、通路富集分析.通过差异表达分析,共获得10 521个差异表达基因,其中5 246个基因仅在低温耐受品种发生表达变化.功能、通路富集分析将差异基因显著富集在包括糖酵解/糖质新生代谢途径在内的144个代谢途径.选取5个基因进行qRT-PCR验证,定量结果与RNA-seq结果相关性达0.89.研究结果表明低温胁迫会显著改变鲤肝胰腺的转录活动,编码糖酵解/糖质新生途径的多个关键酶基因在低温耐受品种的表达量显著高于低温敏感品种,推测这些基因功能有助于其长期低温适应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵凯	中国科学院西北高原生物研究所	89	1212	16.0	33.0
2	乔志刚	河南师范大学水产学院	57	434	13.0	17.0
3	张存芳	中国科学院西北高原生物研究所	4	17	3.0	4.0
4	田菲	中国科学院西北高原生物研究所	2	25	2.0	2.0
5	刘思嘉	中国科学院西北高原生物研究所	2	2	1.0	1.0