不同鸡种BF1基因SNP和Indel比对分析

• 作者: 常国斌 张扬 张莘 王志秀 王统苗 郑圣晗 陈博雯 陈国宏
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡MHC BF1基因 SNP INDEL
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医?水产养殖
• 页码范围: 1087-1094
• 页数: 8页
• 分类号: S858.31
• 字数: 3421字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.05.017

摘要

鸡BF1基因多态性与传染性疾病的抗性有很大关系.鸡BF1基因多态性及功能尚不清楚.本研究直接测定了25个鸡种BF1基因序列,并与从NCBI下载的红色原鸡BF1基因进行了比较,构建系统进化树进行分析.结果显示,在这25个鸡种中共检测到了171个单核苷酸多态性(SNP),其中外显子上发现了108个SNP.这些外显子中SNP位点编码氨基酸166个,其中有58个氨基酸发生变异,氨基酸序列同源性高于核苷酸.外显子4和外显子1的SNP数量最多,占46％以上,第5、第6、第7、第8外显子属于保守区域.核苷酸序列缺失主要发生在外显子1和内含子5上.25个鸡种根据地理位置和气候环境大致可被分为3大类.说明,BF1基因在核苷酸多态性水平上存在较高的变异性,为鸡抗病育种提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈国宏	扬州大学动物科学与技术学院	393	3876	28.0	46.0
2	张扬	扬州大学动物科学与技术学院	59	219	7.0	13.0
3	陈博雯	扬州大学动物科学与技术学院	5	5	2.0	2.0
4	郑圣晗	扬州大学动物科学与技术学院	7	8	2.0	2.0
5	王志秀	扬州大学动物科学与技术学院	7	2	1.0	1.0
6	王统苗	扬州大学动物科学与技术学院	4	5	2.0	2.0
7	张莘	扬州大学动物科学与技术学院	2	2	1.0	1.0