广泛期与局限期小细胞肺癌差异表达miRNAs的筛选及生物信息学分析

• 作者: 罗波 耿涛 薛亚军 魏育涛 黄冰
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 小细胞肺癌 肿瘤转移 微小RNA 生物信息学 基因芯片
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: R734.2
• 字数: 2755字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2018.12.001

摘要

目的 筛选广泛期与局限期小细胞肺癌(SCLC)间差异表达的miRNAs,分析差异表达miRNAs的靶基因功能.方法 从高通量基因表达数据库中下载SCLC转移基因芯片数据GSE67804,采用Qlucore Omics Explorer3.0软件筛选广泛期SCLC(ED组)、局限期SCLC(LD组)患者血清中的差异表达miRNAs,通过生物信息学方法预测差异miRNAs靶基因,并对靶基因迸行 GO 功能富集分析、KEGG 信号通路分析以及 STRING 蛋白互作分析.结果 ED组与LD组筛选出17个差异表达miRNAs(P<0.05,|Fold change|≥2).生物信息学分析发现,差异miRNAs互补结合的靶基因在胞吞作用、Ras通路、Rap1通路、PI3K-Akt通路、局部黏附等肿瘤相关通路明显富集,靶基因信号传导及转录激活因子(STAT3)、SMAD3、E2F1、基质金属蛋白2(MMP2)、SP1、雄激素受体(AR)、胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)、核因子κB1(NFκB1)、蛋白激酶2(AKT2)编码的蛋白在互作网络中具有核心地位.结论 广泛期与局限期SCLC间存在17个差异表达miRNAs,这些miRNAs可能通过调控Ras、Rap1、PI3K-Akt等信号通路,迸而调节下游靶蛋白参与SCLC转移的发生过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏育涛	石河子大学医学院	28	78	5.0	7.0
2	耿涛	石河子大学医学院	9	31	3.0	5.0
3	薛亚军	石河子大学医学院	10	17	3.0	4.0
4	罗波	石河子大学医学院	12	31	3.0	5.0
5	黄冰	石河子大学医学院	7	24	3.0	4.0