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意大利蜜蜂工蜂中肠响应Nosema ceranae胁迫的高表达基因分析
意大利蜜蜂工蜂中肠响应Nosema ceranae胁迫的高表达基因分析
作者:
付中民
刀晨
熊翠玲
耿四海
郑燕珍
郭睿
陈大福
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
RNA-seq
意大利蜜蜂
中肠
Nosema ceranae
高表达基因
摘要:
东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae是专性寄生蜜蜂中肠上皮细胞的单细胞真菌,对意大利蜜蜂(意蜂)具有较强的侵染性.本研究利用RNA-seq技术对正常10 d(Apis mellifera ligustica control group,AmCK)和N.ceranae胁迫10 d的意蜂工蜂中肠(Apis mellifera ligustica treatment group,AmT)进行测序,共得到160 847 237 100条原始读段,过滤后得到1 066 955 298条有效读段.主成分分析结果显示AmCK与AmT测序样品的组内重复性较好,组间的基因表达模式差异明显.GO分类结果显示,AmCK与AmT的前100位高表达基因(HEGs)分别分布于32和33个GO terms,基因富集数最多的均为代谢进程.KEGG代谢通路(pathway)富集分析结果显示,AmCK的前100位HEGs富集在21个pathways,基因富集数最多的是内吞作用、信号通路和嘌呤代谢;AmT的前100位HEGs富集在26个pathways,基因富集数最多的是内吞作用、RNA转运和蛋白质的内质网加工.前100位HEGs的Venn分析结果显示AmCK与AmT的共有HEGs为87个,特有HEGs分别均为13个.研究结果揭示了Ⅳ.ceranae胁迫意蜂工蜂中肠过程中的基因表达谱信息,也为解析Ⅳ.ceranae致病的分子机理提供了有益信息和线索.
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文献信息
篇名
意大利蜜蜂工蜂中肠响应Nosema ceranae胁迫的高表达基因分析
来源期刊
环境昆虫学报
学科
农学
关键词
RNA-seq
意大利蜜蜂
中肠
Nosema ceranae
高表达基因
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
1106-1112
页数
7页
分类号
Q968.1|S89
字数
5768字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-0858.2018.05.18
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
付中民
福建农林大学蜂学学院
33
121
6.0
9.0
2
陈大福
福建农林大学蜂学学院
47
227
8.0
12.0
3
熊翠玲
福建农林大学蜂学学院
17
53
4.0
6.0
4
郭睿
福建农林大学蜂学学院
19
42
4.0
4.0
5
郑燕珍
福建农林大学蜂学学院
14
45
4.0
6.0
6
刀晨
福建农林大学蜂学学院
1
5
1.0
1.0
7
耿四海
福建农林大学蜂学学院
1
5
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研究主题发展历程
节点文献
RNA-seq
意大利蜜蜂
中肠
Nosema ceranae
高表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
环境昆虫学报
主办单位:
广东省昆虫学会中国昆虫学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-0858
CN:
44-1640/Q
开本:
16开
出版地:
广州市新港西路105号
邮发代号:
46-18
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
2184
总下载数(次)
4
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