利用GEO及TCGA数据集分析SMARCA1在胃癌中的表达及其临床意义

• 作者: 李智 王硕 郭天舒 郭金锋
• 来源期刊: 临床肿瘤学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 基因表达汇编(GEO) 癌症和肿瘤基因图谱(TCGA) SMARCA1 预后
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 528-532
• 页数: 5页
• 分类号: R735.2
• 字数: 2910字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0460.2018.06.010

摘要

目的 探讨基因表达汇编(GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(TCGA)数据集中胃癌组织的SMARCA1表达情况及其与胃癌临床病理特征和预后的关系.方法 利用GEO和TCGA数据集汇总胃癌相关数据,下载胃癌组织SMARCA1表达数据及临床病理参数.分析SMARCA1表达与胃癌临床病理学特征和总生存期(0S)的关系;采用基因集富集分析(GSEA)预测SMARCA1相关的基因通路.结果 在GSE62254数据集中,SMARCA1表达与T分期有关(P=0.022),而与TNM分期、性别、年龄和N分期均无关(P＞0.05).在TCGA数据集中,SMARCA1表达与T分期、性别、年龄、N分期、TNM分期和组织学分级均无关(P＞0.05).GSE62254数据集中,SMARCA1高、中及低表达组胃癌患者的中位OS分别为36.4个月、89.4个月和未达(P=0.001);TCGA数据集中,SMARCA1高、中及低表达组胃癌患者的中位OS分别为23.7个月、29.4个月和56.2个月(P=0.033).GSEA结果显示,SMARCA1高表达样本富集了K-Ras、Akt、BMI-1和mTOR通路等基因集.结论 胃癌组织中SMARCA1的表达与T分期有关,高表达患者的预后不良,可作为潜在评估胃癌预后的分子标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭金锋	沈阳中国医科大学附属第一医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0
2	王硕	沈阳中国医科大学附属第一医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0
3	郭天舒	沈阳中国医科大学附属第一医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0
4	李智	沈阳中国医科大学附属第一医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0