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核糖体结合糖蛋白2在脑胶质瘤中的表达及其在预后评估中的作用
核糖体结合糖蛋白2在脑胶质瘤中的表达及其在预后评估中的作用
作者:
孙思
张克难
张莹
王宽宇
王政
胡慧敏
赵征
黄华
黄若愚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
神经胶质瘤
基因表达谱
预后
核糖体结合糖蛋白2
生物学过程
摘要:
目的探 讨核糖体结合糖蛋白2(RPN2)在脑胶质瘤中的表达模式,以及其与患者的临床特征及预后的关系.方法 回顾性分析309例来自中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)的脑胶质瘤患者的临床资料及其mRNA测序数据,分析RPN2基因的表达模式.对2016-2017年首都医科大学附属北京天坛医院收治的30例脑胶质瘤患者肿瘤样本采用实时荧光定量PCR验证RPN2基因的表达情况.根据RPN2基因的表达水平,将所有样本分为低表达组(154例)和高表达组(155例).以癌症基因组图谱数据库(TCGA)的mRNA测序数据和REMBRANDT的mRNA芯片数据作为独立验证数据集.采用方差分析和t检验分析RPN2基因的表达特征.应用Kaplan-Meier生存曲线、Log-rank检验以及Cox回归分析方法评价RPN2基因在脑胶质瘤患者预后评估中的作用.通过DAVID软件分析RPN2基因参与的GO生物学过程和KEGG信号通路.结果 CGGA mRNA测序数据显示,在世界卫生组织(WHO)Ⅱ、Ⅲ以及Ⅳ级脑胶质瘤中,RPN2的表达水平呈升高趋势(分别为-0.55±0.61、0.05±0.66以及0.36±1.20,P<0.0001);实时荧光定量PCR也证实,RPN2的表达水平随胶质瘤WHO等级的升高呈逐渐升高的趋势.在TCGA脑胶质瘤的4个分型中,RPN2在神经元型中表达最低,在间质型中表达最高(分别为-0.80±0.56和0.68±1.02,P<0.001).RPN2在IDH突变型脑胶质瘤中的表达低于其在野生型中的表达(分别为-0.22±0.77和0.22±1.18,P<0.001).RPN2基因高表达组脑胶质瘤患者的总体生存期小于低表达组(P <0.001).RPN2基因的上述特征均在TCGA mRNA测序数据及REMBRANDT mRNA芯片数据集中得到类似的结果.多因素Cox分析显示,RPN2基因的表达水平是脑胶质瘤患者预后的独立预测因子(P=0.004).RPN2基因可能参与脑胶质瘤细胞的凋亡、分裂、增殖、黏附、血管生成等生物学过程.结论 RPN2基因与脑胶质瘤的恶性程度密切相关,可作为判断患者预后的指标及潜在的治疗靶点.
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篇名
核糖体结合糖蛋白2在脑胶质瘤中的表达及其在预后评估中的作用
来源期刊
中华神经外科杂志
学科
关键词
神经胶质瘤
基因表达谱
预后
核糖体结合糖蛋白2
生物学过程
年,卷(期)
2018,(11)
所属期刊栏目
基础论著
研究方向
页码范围
1155-1160
页数
6页
分类号
字数
5004字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1001-2346.2018.11.018
五维指标
传播情况
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基因表达谱
预后
核糖体结合糖蛋白2
生物学过程
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中华神经外科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-2346
CN:
11-2050/R
开本:
大16开
出版地:
北京市丰台区南四环西路119号B区1号楼10层1001
邮发代号:
18-56
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7686
总下载数(次)
12
总被引数(次)
66548
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