"中国病原分枝杆菌质谱数据库"构建及验证

• 作者: 刘东鑫 李亚楠 李修远 杨本善 王玫 赵雁林 鲁辛辛
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 关键词: 分枝杆菌科 光谱法,质量,基质辅助激光解吸电离 数据库 质量控制
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 519-526
• 页数: 8页
• 字数: 4171字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.07.008

摘要

目的 构建国产基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)仪的病原分枝杆菌鉴定数据库,评价其鉴定准确性并与国外同类产品比较.方法 "中国病原分枝杆菌质谱数据库"的构建:收集分枝杆菌国际标准菌株19种、19株及"资源化"分枝杆菌临床分离株42种、183株;采用改良研磨-超声裂解法提取菌体蛋白.以国产MALDI-TOF MS仪(microTyper MS)为基础进行谱图采集及数据库构建,每株菌提取物平行滴加于12个靶点,每个靶点采集2次,得到24张质谱图;后按标准精选20张优质谱图,设置最大出峰数目、最小出峰频率及质量容差,经分析软件生成主谱图(MSP).数据库验证:收集不同地区来源分枝杆菌305株,以16S rRNA基因、hsp65及rpoB测序为金标准,比较以本数据库为基础的microTyper MS与以Mycobacteria Library 3.0数据库为基础的进口MALDI-TOF MS仪(MALDI-TOF MS Microflex)鉴定分枝杆菌的准确性及谱图特征.结果 构建的"中国病原分枝杆菌质谱数据库"容量为42种、202株,平均每种纳入菌株4.8株,排在前10位的是堪萨斯分枝杆菌16株、胞内分枝杆菌16株、戈登分枝杆菌16株、偶发分枝杆菌16株、鸟分枝杆菌16株、脓肿分枝杆菌16株、结核分枝杆菌15株、马赛分枝杆菌11株、阿罗普研院分枝杆菌10株及yongongens分枝杆菌2株;305株验证菌株经测序确认为29种;基于本数据库,种水平鉴定准确率为99.67％(304/305),高于MALDI-TOF MS Microflex(97.38％,297/305),差异有统计学意义(χ2=4.06,P<0.05).结论 构建的"中国病原分枝杆菌质谱数据库"质量达到临床常规应用要求,就国内流行株而言,鉴定准确率优于国外同类产品.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王玫	首都医科大学附属北京同仁医院检验科	39	196	8.0	12.0
2	鲁辛辛	首都医科大学附属北京同仁医院检验科	90	682	15.0	21.0
3	赵雁林	中国疾病预防控制中心结核病预防控制中心	77	651	14.0	22.0
4	刘东鑫	中国疾病预防控制中心结核病预防控制中心	5	8	2.0	2.0
5	李修远	首都医科大学附属北京同仁医院检验科	6	36	4.0	6.0
6	李亚楠	首都医科大学附属北京同仁医院检验科	11	48	5.0	6.0
7	杨本善	首都医科大学附属北京同仁医院检验科	7	37	4.0	6.0