牦牛IGF-IR基因克隆及其序列分析

• 作者: 吴晓云 梁春年 王宏博 褚敏 郭宪 阎萍
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 IGF-IR基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 39-45
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S823
• 字数: 4661字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.04.006

摘要

为研究牦牛胰岛素样生长因子1受体基因(IGF-IR)的结构和功能,采用同源克隆和RT-PCR方法分段扩增牦牛IGF-IR,拼接获得全长序列,利用生物学软件进行分析.结果表明,牦牛IGF-IR基因ORF长约4104 bp,编码1367个氨基酸;理论分子量约154.95 ku,等电点pI值约5.71.与黄牛IGF-IR比较,牦牛IGF-IR基因序列有20处碱基改变,其中G到T碱基颠换2次,G到A碱基转换2次,C到T碱基转换7次,A到G碱基转换3次,T到C碱基转换6次,以及3个位点氨基酸改变(G6R、T29I和S30I).系统进化分析表明,牦牛与黄牛、猪、人、狗、小鼠、猩猩等物种IGF-IR氨基酸相似性均大于92％,处于同一进化分支,具有高度同源性.蛋白结构预测表明,牦牛IGF-IR包含半胱氨酸富集区(FU)、纤连蛋白Ⅲ型结构域(FN3)、跨膜结构域(TM)及酪氨酸蛋白激酶区(TyrKc),具有该受体家族的特征结构域.同源建模表明,其成熟区段氨基酸序列与人的IGF-IR有98.68％的相似性.为后续牦牛IGF-IR基因的功能研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阎萍	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所	114	620	14.0	21.0
2	郭宪	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所	92	369	10.0	15.0
3	梁春年	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所	70	417	11.0	18.0
4	吴晓云	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所	12	170	4.0	12.0
5	王宏博		3	2	1.0	1.0
6	褚敏		1	1	1.0	1.0