基于ITS序列的灵芝遗传多样性与群体遗传分化研究

• 作者: 刘雪莹 司静 崔宝凯 李春道 韩玉立
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: ITS序列 分子标记 单倍型 基因流 药用菌
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 565-575
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.180019

摘要

本研究基于ITS序列对中国8个不同地理群体的168份灵芝样本的分子变异、遗传多样性、群体遗传分化程度进行了分析.结果表明:168个样品中共检测到39个单倍型(H1-H39),表现出较低的遗传多样性水平(Hd=0.867±0.018,Pj=0.00304±0.00024),各群体的遗传多样性水平相差不大:TCS单倍型网络图和基于ML、NJ法构建的单倍型系统发育树显示,各地理群体的遗传距离与地理距离之间没有形成对应关系,二者没有明显的相关性;AMOVA分析结果显示不同地理群体间的遗传变异占4.33％,群体内的变异占95.67％,遗传分化主要来自于群体内部.总体和各地理群体的中性检验结果显示,群体扩张遵循中性进化,群体大小保持相对稳定.整体的遗传分化指数Fst为0.04331,基因流Nm为2.99,表明各地理群体间存在频繁的基因交流,群体遗传分化较小.推测原因可能为种群扩张历史较短,分布范围较窄,造成遗传多样性偏低,各群体间遗传分化不大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔宝凯	北京林业大学微生物研究所	67	869	16.0	26.0
2	司静	北京林业大学微生物研究所	27	403	10.0	19.0
3	韩玉立	北京林业大学微生物研究所	3	14	2.0	3.0
4	刘雪莹	北京林业大学微生物研究所	1	5	1.0	1.0
5	李春道		2	20	2.0	2.0