基于16S rRNA测序的海南坡鹿肠道菌群结构分析

• 作者: 杨锴斌 王悦 田秀华 苏力 陈兴永 陈武
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 海南坡鹿 肠道菌群 16S rRNA
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 761-768
• 页数: 8页
• 分类号: Q93
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0127.2018.04.005

摘要

通过构建菌群16S rRNA基因克隆文库和进行系统发育分析,对采集自广州动物园健康成年海南坡鹿的16个粪便样品的菌群结构和多样性进行分析,结果表明海南坡鹿粪便菌群分属于18个菌门,其中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是核心菌门,分别占比50.49％和36.52％.海南坡鹿肠道菌群中丰度最高的前10个属分别为5-7N15丰度值为7.181％、普雷沃菌属(Prevotella,3.159％)、密螺旋体属(Treponema,2.788％)、琥珀酸弧菌属(Succinivibrio,2.545％)、颤螺菌属(Oscillospira,2.304％)、CF231丰度值1.843％、瘤胃球菌属(Ruminococcus,1.652％)、艾克曼菌属(Akkermansia,1.439％)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter,1.340％)、梭菌属(Clostridiu,1.333％).对比不同性别海南坡鹿(Cervus eldi hainanus)肠道菌群,通过t检验,统计出具有差异显著(P＜0.05)的属共17个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田秀华		108	927	17.0	23.0
2	王悦		1	7	1.0	1.0
3	杨锴斌		1	7	1.0	1.0