甘肃黑猪H-FABP基因多态性筛查及蛋白功能预测

• 作者: 农伟伦 刘丽霞 卢建雄 张丽 张国华 李慧洁
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘肃黑猪 H-FABP基因 DNA池 单核苷酸多态性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 46-52
• 页数: 7页
• 分类号: S828|Q78
• 字数: 4877字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.04.007

摘要

为了明确甘肃黑猪H-FABP基因的遗传特征,采用DNA池结合直接测序技术快速筛查甘肃黑猪H-FABP基因遗传多态性,并利用生物信息学方法预测其编码氨基酸的理化性质及蛋白功能.结果显示,甘肃黑猪H-FABP基因在扩增区域共发现4个突变位点,分别为C734 T-Intron1、T152 C-Exon2、G30 A-Intron2、T121 G-Intron2,各等位基因频率在突变前后存在明显差异;该基因编码区全长402 bp,共编码133个氨基酸残基,其中,编码区序列有1个T152 C-Exon2的错义突变,氨基酸由原来非极性的异亮氨酸(Ile)转变为极性的苏氨酸(Thr);H-FABP编码蛋白是一种稳定的亲水性蛋白,二、三级结构均为混合型,β-折叠所占比例最高.蛋白质功能预测结果显示,甘肃黑猪H-FABP编码蛋白存在19个潜在磷酸化位点和1个N-糖基化位点,可能会影响H-FABP基因调控肌内脂肪含量的增加.同源性比较和系统发育树分析表明,甘肃黑猪与偶蹄目动物亲缘关系最近.研究结果可为甘肃黑猪肌内脂肪含量沉积的分子遗传标记提供理论基础,该基因的多态性筛选已成为家畜肉质性状改良的分子研究热点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢建雄	西北民族大学生命科学与工程学院	62	330	11.0	15.0
2	刘丽霞	西北民族大学生命科学与工程学院	60	132	6.0	9.0
3	张国华	西北民族大学生命科学与工程学院	16	35	3.0	5.0
4	张丽	西北民族大学生命科学与工程学院	53	105	5.0	6.0
5	李慧洁	西北民族大学生命科学与工程学院	3	3	1.0	1.0
6	农伟伦	西北民族大学生命科学与工程学院	3	6	2.0	2.0