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摘要:
目的:研究九里香中香豆素类成分与骨桥蛋白的结合模式和相互作用.方法:采用AutoDock 4.2分子对接软件,将九里香中香豆素类成分共36个化合物和阳性对照单克隆抗体23C3的二维结构转化成三维结构,确立其空间坐标,再设置受体蛋白的网格,并运行对接程序,进行对接运算.结果:化合物13和化合物20对接的Ki分别为5.71 μmol·L-和4.11μmol· L-1,小于阳性对照23C3对接的Ki值19.95 μmol·L-1,对接数据最差的是化合物4,Ki值为154.48 μmol·L-1.对接构象上,23C3基本占据骨桥蛋白的疏水口袋和亲水口袋,化合物13和化合物20落人到骨桥蛋白的疏水口袋,与周围的Tyr49形成疏水相互作用力,表现出较强的结合能力;而化合物4既未占据骨桥蛋白疏水口袋,也未落入骨桥蛋白的亲水口袋,空间上与骨桥蛋白的活性位点不匹配,虚拟活性较弱.结论:九里香中香豆素成分有较强的抗炎活性,其中化合物13和化合物20虚拟活性最强,甚至强于阳性对照单克隆抗体23C3,化合物4在空间上与骨桥蛋白活性腔不匹配,虚拟活性最弱.化合物13和化合物20并未伸入骨桥蛋白的亲水活性口袋,是其结构修饰的方向,本研究将为骨桥蛋白抑制剂的开发提供一定理论指导.
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文献信息
篇名 九里香中香豆素类成分抗骨关节炎的分子对接研究
来源期刊 赣南医学院学报 学科 医学
关键词 九里香 香豆素 骨关节炎 分子对接
年,卷(期) 2018,(9) 所属期刊栏目 骨关节炎专题
研究方向 页码范围 847-851
页数 5页 分类号 R285
字数 3504字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-5779.2018.09.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 吴龙火 赣南医学院药学院 43 160 8.0 11.0
2 郭小华 赣南医学院药学院 21 105 6.0 10.0
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九里香
香豆素
骨关节炎
分子对接
研究起点
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
赣南医学院学报
月刊
1001-5779
36-1154/R
大16开
江西赣州市医学院路1号
1979
chi
出版文献量(篇)
9125
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7
总被引数(次)
20114
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