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九里香中香豆素类成分抗骨关节炎的分子对接研究
九里香中香豆素类成分抗骨关节炎的分子对接研究
作者:
吴龙火
朱燕亮
郭小华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
九里香
香豆素
骨关节炎
分子对接
摘要:
目的:研究九里香中香豆素类成分与骨桥蛋白的结合模式和相互作用.方法:采用AutoDock 4.2分子对接软件,将九里香中香豆素类成分共36个化合物和阳性对照单克隆抗体23C3的二维结构转化成三维结构,确立其空间坐标,再设置受体蛋白的网格,并运行对接程序,进行对接运算.结果:化合物13和化合物20对接的Ki分别为5.71 μmol·L-和4.11μmol· L-1,小于阳性对照23C3对接的Ki值19.95 μmol·L-1,对接数据最差的是化合物4,Ki值为154.48 μmol·L-1.对接构象上,23C3基本占据骨桥蛋白的疏水口袋和亲水口袋,化合物13和化合物20落人到骨桥蛋白的疏水口袋,与周围的Tyr49形成疏水相互作用力,表现出较强的结合能力;而化合物4既未占据骨桥蛋白疏水口袋,也未落入骨桥蛋白的亲水口袋,空间上与骨桥蛋白的活性位点不匹配,虚拟活性较弱.结论:九里香中香豆素成分有较强的抗炎活性,其中化合物13和化合物20虚拟活性最强,甚至强于阳性对照单克隆抗体23C3,化合物4在空间上与骨桥蛋白活性腔不匹配,虚拟活性最弱.化合物13和化合物20并未伸入骨桥蛋白的亲水活性口袋,是其结构修饰的方向,本研究将为骨桥蛋白抑制剂的开发提供一定理论指导.
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文献信息
篇名
九里香中香豆素类成分抗骨关节炎的分子对接研究
来源期刊
赣南医学院学报
学科
医学
关键词
九里香
香豆素
骨关节炎
分子对接
年,卷(期)
2018,(9)
所属期刊栏目
骨关节炎专题
研究方向
页码范围
847-851
页数
5页
分类号
R285
字数
3504字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-5779.2018.09.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
吴龙火
赣南医学院药学院
43
160
8.0
11.0
2
郭小华
赣南医学院药学院
21
105
6.0
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节点文献
九里香
香豆素
骨关节炎
分子对接
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
赣南医学院学报
主办单位:
赣南医学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-5779
CN:
36-1154/R
开本:
大16开
出版地:
江西赣州市医学院路1号
邮发代号:
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
9125
总下载数(次)
7
总被引数(次)
20114
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