银杏MADS-box基因家族的表达及系统发育分析

• 作者: 何崇单 刘伟 李萌 王义强 王俊燚 王启业 董金金 蔡雨蒙
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 银杏 MADS-box基因家族 开花调控 花器官发育
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1055-1063
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2017.0574

摘要

MADS-box基因是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物花器官发育中发挥重要的调控作用.为了探究MADS-box家族基因在银杏花发育中的功能,本文对银杏花芽分化4个时期的样品进行转录组测序,筛选其中的MADS-box家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位和系统进化分析.结果显示:共得到15个银杏MADS-box家族基因.表达分析表明,目标基因根据表达模式可以分为3种类型.分析目标基因的编码序列显示,15个银杏MADS-box蛋白的主要构件均为α-螺旋和无规则卷曲;亚细胞定位预测主要在细胞核内;所有表达产物均包含MADS结构域.聚类分析显示,银杏MADSbox基因家族可分为6个亚类.银杏MADS-box基因家族中的newGb2734、Gb38883、Gb28587和Gb33168可能在银杏开花调控中发挥重要作用;Gb16301可能是银杏花器官的发育过程中的关键基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘伟		22	209	7.0	14.0
2	王义强		49	582	15.0	22.0
3	李萌		12	20	3.0	4.0
4	王启业		12	96	5.0	9.0
5	董金金		2	1	1.0	1.0
6	王俊燚		2	1	1.0	1.0
7	何崇单		1	0	0.0	0.0
8	蔡雨蒙		1	0	0.0	0.0