基于转录组测序的银杏类黄酮生物合成关键基因表达分析

• 作者: 何崇单 刘伟 李萌 汪贵斌 王义强 王俊燚 董金金 郁万文
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 银杏 转录组 类黄酮 黄酮醇 Illumina HiSeq 2000
• 年，卷（期）: 2018,（23）
• 页码范围: 5633-5639
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.23.024

摘要

目的 对银杏进行转录组测序,分析银杏生长发育不同时期类黄酮生物合成关键基因的表达.方法 以银杏幼年树和成年树不同时期叶片作为供试材料,利用Illumina HiSeq 2000进行转录组测序,对Unigene 进行功能注释,分析银杏类黄酮生物合成关键基因的表达特征.结果 转录组测序共获得43 073条Unigene,其中35 179条被注释,基因差异表达(DEG)筛选得到5 117个基因.通过对类黄酮合成相关KEGG 途径进行分析,筛选出50条候选基因.分析50条候选基因的表达规律,发现类黄酮合成关键基因均在银杏幼叶中高表达,但在成年树与幼年树同时期叶片之间表达差异不显著.分析与类黄酮合成关系密切的13个基因发现,其中肉桂酸4-羟化酶(C4H)、查耳酮合成酶(CHS)、花青素合成酶(ANS)、花青素还原酶(ANR)和类黄酮O-甲基转移酶(FOMT)基因的表达量较高,类黄酮3′-羟化酶(F3′H)、类黄酮3′,5′-羟化酶(F3′5′H)和黄酮醇合成酶(FLS)基因的表达量则相对较低.结论 通过转录组高通量测序,筛选分析了银杏类黄酮生物合成的关键基因及其表达特征,为提高银杏类黄酮产量提供了分子生药学理论基础.