甘薯引进种SSR遗传多样性分析

• 作者: 唐君 曹清河 王娇 苏一钧 赵冬兰 赵路宽 陈艳丽 霍恺森
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯引进种 SSR 遗传多样性 群体结构
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种?生理生化
• 页码范围: 984-997
• 页数: 14页
• 分类号: S531.024
• 字数: 3512字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.05.004

摘要

通过SSR分子标记,对112份甘薯引进种进行了遗传多样性和群体结构分析,并与中国地方种进行了聚类比较分析.研究了中国目前保存最多的甘薯引进种间的遗传多样性和亲缘关系,以及与地方种间的遗传多样性关系.用SSR建立研究材料的0,1数据库,用ntsys-pc 2.10软件计算遗传距离矩阵并导入MEGA 6.06聚类,利用STRUCTURE 2.3.4软件对112份引进种进行群体结构分析,并将112份引进种与58份中国地方种共170份进行聚类分析.结果表明:112份材料的平均遗传距离为0.552,遗传距离分布在0.031到0.949范围之内.使用Neighbor-Joining(NJ)聚类法,在遗传距离为0.442处将112份材料分成9个类群,其中类群9又在遗传距离为0.428处,分为3个亚群.亚群ⅨC含有39份材料,该亚群主要来自南美洲,聚类集中,血缘较为单一.通过群体结构分析将112份材料划分成了2个群体,通过对引进种的来源地比较分析,发现来自南美洲与其他地区种质材料分属于2个群体.通过对引进种和地方种共计170份甘薯资源聚类比较分析,发现中国大陆地方种与中国台湾品种间亲缘关系最近,与东南亚、东北亚、南美洲甘薯引进种间亲缘关系较近,与国际马铃薯中心、国际热带农业研究所的材料和世界蔬菜中心的材料亲缘关系较远.