变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸操纵子的克隆与分析

• 作者: 孙文敬 崔凤杰 张晓飞 李运哲 栾方 王大明 郭钦 齐向辉
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 变形假单胞菌 2-酮基葡萄糖酸操纵子 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 分析与检测
• 页码范围: 292-298
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2018.04.038

摘要

从变形假单胞菌JUIM01中克隆2-酮基葡萄糖酸操纵子(kgu操纵子),明确其基因组成及生物学信息.根据报道的假单胞菌的基因组信息设计简并引物,采用LA-PCR技术克隆变形假单胞菌的kgu操纵子,对克隆的基因片段进行测序,在此基础上利用生物信息学方法进行分析.结果表明:克隆到的基因片段全长为6 130bp,其中包括基因ptxS、kguE、kguK、kguT和kguD,分别编码2-酮基葡萄糖酸代谢调控蛋白PtxS、2-酮基葡萄糖酸差向异构酶、2-酮基葡萄糖酸激酶、2-酮基葡萄糖酸转运蛋白和2-酮基葡萄糖酸-6-磷酸还原酶;这些基因与铜绿假单胞菌PAOl的kgu操纵子中相应基因的序列一致性达56.15％ ～76.74％,然而变形假单胞菌的ptxS很可能并不位于kgu操纵子中.研究首次从变形假单胞菌中克隆到kgu操纵子,并对其进行生物信息学分析,为变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸代谢机理的研究奠定了基础.