2017年深圳地区冬季诺如病毒基因分型与流行病学分析

• 作者: 刘洋 周艳 李鸿钧 杜静 林晓晨 汪艺 陈林林
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 诺如病毒 基因型 系统发生树 同源性分析
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 微生物学
• 页码范围: 725-730
• 页数: 6页
• 字数: 4281字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2018.10.002

摘要

目的 对深圳地区2017年冬季诺如病毒(Norovirus,NoV)流行株基因型、流行病学特点及同源性进行分析和研究.方法 通过提取313份粪便样品的核酸后利用NoV特异性引物进行逆转录PCR(RT-PCR),将阳性PCR产物测序.根据样品测序序列及NoV参考株序列,利用软件Mega 4.1及Clustal W构建系统发生树.结果 NoV阳性样品共26份且均为GⅡ.4型,分别与GⅡ.4(KY407156)、GⅡ.4(KY580757)及GⅡ.4(KX372682)具有较高的同源性.此外,88.46％ 的NoV样品与本地区历年流行株同源性较低,且46.15％ 与我国其他地区流行株存在差异.结论2017年冬季深圳地区诺如病毒流行株以GⅡ.4型为主,且其在流行性及同源性上具有自身的特点,在当地公共卫生工作中需加强关注.