植原体tuf基因与其上游部分基因结构和相关基因启动子保守区域特征及活性分析

• 作者: 于少帅 张文鑫 林彩丽 王圣洁 田国忠
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: 植原体 启动子 基因结构 遗传多样性 多位点序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 微生物多样性
• 页码范围: 738-748
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2018017

摘要

植原体寄主种类多,危害范围广,开展其遗传多样性、关键基因调控等方面研究有助于提高该病害综合防治水平.通过长片段PCR引物扩增我国PaWB-sdyz,PaWB-fjfz和LY-fjyal植原体株系tuf基因及其上游6个基因的片段,进行植原体基因启动子保守区域序列特征和多位点序列分析.利用启动子探针载体pSUPV4检测植原体tuf基因上游序列的启动子活性.扩增获得PaWB-sdyz、PaWB-fjfz、LY-fjyal株系tuf基因上游12,745-12,748 bp序列,比较分析发现PaWB-sdyz、PaWB-fjfz、LY-fjyal、OY-M、AYWB、PAa、SLY、AT植原体株系tuf与其上游6个基因的结构顺序皆为5’-rplL-rpo B-rpoC-rpsl2-rps 7-fusA-tuf-3’.推测出可能的植原体启动子保守区域模式序列:T90T100G92T75G67A85(-35区);T90A96T92A98T73T90(-10区).基于8个植原体株系的rplL-tuf核苷酸序列编码基因、非编码序列、氨基酸序列的多位点序列分析可将不同植原体株系以较高的支持率清晰地区分,不同植原体株系rplL-tuf核苷酸非编码区变异水平更高.16SrI组植原体tuf基因上游序列存在3种变异类型,其代表株系PaWB-fjfz、LY-fjyal tuf基因上游130 bp片段和CWB-hnsy1 tuf基因上游129 bp片段皆具有启动子活性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林彩丽	中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室	9	22	3.0	4.0
2	于少帅	中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室	4	3	1.0	1.0
3	王圣洁	中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室	3	2	1.0	1.0
4	张文鑫	中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室	1	0	0.0	0.0