猪MYNN基因可变剪接体的克隆及表达特性研究

• 作者: 乐宝玉 刘剑锋 刘小军 张宁芳 成志敏 曹果清 李步高 李萌 郭晓红 高鹏飞
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 MYNN 可变剪接 生物信息学 表达特性
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 477-487
• 页数: 11页
• 分类号: S828.2|Q344
• 字数: 6977字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.03.003

摘要

旨在克隆猪MYNN基因的可变剪接体,并预测编码蛋白的结构与功能,研究各转录本的时空表达特性.本研究以马身猪为试验动物,采用RT-PCR技术对猪MYNN基因全长CDS区进行克隆,并采用生物信息学技术分析其编码蛋白的生物学特性;在心、肝、脾、肺、肾、小脑、小肠、胰、胃、肌肉和脂肪组织中,采用实时荧光定量PCR技术对MYNN基因的表达谱进行研究,并在胃和肌肉组织中进行发育性表达规律的研究.结果表明,本研究成功克隆出猪MYNN基因的两个转录本MYNN-1(GenBank登录号:KY470829)和MYNN 2(GenBank登录号:KY670835).MYNN-1的CDS区全长1 830 bp,编码609个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性可溶性稳定蛋白质;MYNM2的CDS区全长1 746 bp,编码581个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性可溶性不稳定蛋白质;与MYNN-1相比,MYNN-2少了84 bp,缺失第6外显子,且通过功能结构域预测发现,MYNN-2比MYNN-1少一个C2 H2类型的锌指蛋白结构域;同源性及进化树分析发现,猪MYNN基因的两个转录本所编码的氨基酸序列与北极熊、山羊、马、家犬等物种的同源性较高,遗传距离较近,说明MYNN基因在进化过程中十分保守.MYNN-1和MYNN-2在马身猪的各个组织中均有表达,且各组织之间表达差异显著(P＜0.05);在马身猪胃、小肠和胰中高表达,脂肪组织中表达量最低.在各组织(除肾)中MYNN-1的表达量均显著或极显著高于MYNN-2(P＜0.05;P＜0.01),说明MYNN-1为主要亚型;随着日龄的增加,MYNN-1和MYNN-2在胃中的表达量均呈现逐渐降低的趋势,在背最长肌中,呈现先上升后下降的趋势.本试验成功克隆了猪MYNN基因的两个可变剪接体,并推测MYNN在猪的消化吸收以及骨骼肌的生长发育过程中有重要作用,但其作用的具体机制还需进一步研究.