变形假单胞菌PtxS蛋白基因的克隆与分析

• 作者: 孙文敬 崔凤杰 张晓飞 李运哲 王大明 齐向辉
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 变形假单胞菌 2-酮基葡萄糖酸 PtxS 克隆 生物信息
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 分析与检测
• 页码范围: 284-291
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2018.04.037

摘要

为从变形假单胞菌中克隆2-酮基葡萄糖酸代谢调控蛋白PtxS的基因,并明确其基本的生物学信息,采用同源比对的方法设计引物,利用TD-PCR技术克隆PtxS的基因,再用生物信息学方法对其进行分析.试验结果表明:克隆的基因片段全长1 023 bp,其序列与铜绿假单胞菌、恶臭假单胞菌等假单胞菌的转录调控蛋白PtxS的基因序列一致性达80％左右,编码由340个氨基酸残基组成的蛋白PtxS.该蛋白与恶臭假单胞菌PtxS的同源性最高,氨基酸序列一致性达88％.该蛋白定位于细胞质,无信号肽和跨膜区,为亲水性蛋白.该蛋白的氨基酸序列中含有多个结构域,其二级结构中α螺旋、延伸链、β转角和无规卷曲所占的比例分别为54.41％,13.53％,10.88％和21.18％.本研究为该基因的表达及表达产物的分离纯化提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	齐向辉	江苏大学食品与生物工程学院	20	81	6.0	8.0
2	张晓飞	江苏大学食品与生物工程学院	3	19	1.0	3.0
3	李运哲	江苏大学食品与生物工程学院	1	1	1.0	1.0