紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析

• 作者: 张健 李敏 李玉娟 王莹 谈峰 郭聪 马祥建
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫叶紫薇 叶色变化 转录组
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1128-1137
• 页数: 10页
• 分类号: S687.9
• 字数: 5787字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.05.023

摘要

对紫叶紫薇新品系的叶片进行RNA-Seq测序和分析,共获取145338条Contig,得到组装的Unigene有53654条,平均长度1186.25 bp.32667条Unigene可以匹配到蛋白质数据库获得注释信息,KEGG和GO注释与富集分析显示,差异DEG主要调节激素信号转导、碳水化合物代谢、核糖体代谢等生物学功能.58个表达差异基因分别对比到毛果杨和拟南芥2个模式植物的数据库,筛出与叶绿素代谢相关候选基因9个,其中2个候选基因共同参与了叶绿素兼类黄酮代谢的调控,2个候选基因可能参与类黄酮代谢过程,它们分别属于DUF547、Polyketide cyc2、Pkinase、Calreticulin、NAD Gly3P dh N、Glyco hydro 9等13个基因家族,主要经氧化还原反应、物质能量代谢、植物激素信号转导等机制介入紫薇叶色调控.本研究结果为探究紫叶紫薇叶色变异的分子机制提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李敏		26	95	5.0	9.0
2	李玉娟		27	118	5.0	10.0
3	王莹		21	38	3.0	4.0
4	张健		22	118	5.0	10.0
5	谈峰		21	48	4.0	6.0
6	郭聪		12	6	2.0	2.0
7	马祥建		10	32	3.0	5.0