花生DGAT基因家族的生物信息学分析

• 作者: 万书波 单雷 孟静静 彭振英 李新国 郑玲 郭峰
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 二酰甘油酰基转移酶(DGAT) 进化 表达模式
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术·遗传育种·种质资源
• 页码范围: 10-18
• 页数: 9页
• 分类号: S565.2|Q7
• 字数: 4803字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2018.06.002

摘要

含油量是花生最重要的品质性状之一.花生油的主要成分是三酰甘油(TAG),二酰甘油酰基转移酶(DGAT)是催化合成TAG的关键酶类,其活性高低与含油量呈正相关.本研究利用生物信息学方法对花生DGAT(AhDGAT)基因家族的进化、基因结构特点、表达模式以及可变剪接等进行了分析.进化分析结果显示, AhDGAT1、AhDGAT2和AhDGAT3亲缘关系较近,与AhWSD/DGAT的亲缘关系稍远.AhDGAT1 具有17 ～18个外显子,AhDGAT2具有7 ～9 个外显子,AhDGAT3 具有2 ～3 个外显子,而AhWSD/DGAT具有3 ～6 个外显子.AhDGAT1 的跨膜区数目为7 ～1 1 个,AhDGAT2 和AhWSD/DGAT为0 ～2 个,AhDGAT3 没有跨膜结构.另外,4个亚家族均具有自己特有的保守结构域和表达模式.AhDGAT1 和AhDGAT2在种子中表达量较高,而AhDGAT3和AhWSD/DGAT在根和叶中的表达量较高.AhDGAT1的可变剪接形式最多,其次为AhWSD/DGAT.花生的4个AhDGAT亚家族具有不同的特点,表明它们可能在进化中具有不同的祖先.