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大豆根系中应答镉胁迫的R2R3-MYB基因分析
大豆根系中应答镉胁迫的R2R3-MYB基因分析
作者:
丁杰
崔敏龙
张晓娜
朴春兰
高振蕊
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大豆根系
镉
转录组测序
R2R3-MYB基因
摘要:
非生命活动所需的重金属镉(Cd),在土壤中以低浓度存在时,便可以产生极强的毒性,影响植物的生长发育.MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,近年的研究表明其广泛参与多种生物学过程.为了解大豆根系中应答镉胁迫的MYB基因,本研究将发芽7天的大豆苗在镉浓度为75 μmol·L-1的培养基中处理0、4、8、12和48 h,采用Illumina HiSeq高通量测序平台对大豆根系进行转录组测序分析,获得16个与镉胁迫应答息息相关的R2R3-MYB基因.氨基酸序列分析表明,这16个MYB转录因子均含有4个保守元件,且均含有R2、R3保守结构域.参考拟南芥R2R3-MYB亚组分类进行系统发生学分析,发现它们分为S1、S2、S8、S15、S17、S20和S22 7个亚组.大豆根系中MYB基因差异表达分析结果显示,镉胁迫条件下,16个R2R3-MYB基因的表达量均发生变化,且表达量变化均在2倍以上,其中6个基因表达下调,最大下调倍数达17倍,10个基因表达上调,最大上调倍数为11倍.进一步分析发现,大豆根系中的MYB基因主要通过调控重金属镉的吸收、转运、解毒过程来缓解镉的毒害作用.本研究通过对大豆根系中应答镉胁迫的R2R3-MYB基因分析,为大豆抗重金属镉育种提供基因资源和理论基础.
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克隆
基因表达
实时荧光定量PCR
内容分析
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文献信息
篇名
大豆根系中应答镉胁迫的R2R3-MYB基因分析
来源期刊
生态学杂志
学科
关键词
大豆根系
镉
转录组测序
R2R3-MYB基因
年,卷(期)
2018,(7)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
2030-2039
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13292/j.1000-4890.201807.005
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
丁杰
中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室
7
167
5.0
7.0
5
崔敏龙
中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室
4
16
3.0
4.0
6
张晓娜
中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室
5
43
3.0
5.0
10
朴春兰
中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室
2
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2.0
传播情况
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同被引文献
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二级引证文献(0)
2019(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
大豆根系
镉
转录组测序
R2R3-MYB基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生态学杂志
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-4890
CN:
21-1148/Q
开本:
大16开
出版地:
沈阳市文化路72号
邮发代号:
8-161
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
7755
总下载数(次)
30
总被引数(次)
161756
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