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摘要:
非生命活动所需的重金属镉(Cd),在土壤中以低浓度存在时,便可以产生极强的毒性,影响植物的生长发育.MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,近年的研究表明其广泛参与多种生物学过程.为了解大豆根系中应答镉胁迫的MYB基因,本研究将发芽7天的大豆苗在镉浓度为75 μmol·L-1的培养基中处理0、4、8、12和48 h,采用Illumina HiSeq高通量测序平台对大豆根系进行转录组测序分析,获得16个与镉胁迫应答息息相关的R2R3-MYB基因.氨基酸序列分析表明,这16个MYB转录因子均含有4个保守元件,且均含有R2、R3保守结构域.参考拟南芥R2R3-MYB亚组分类进行系统发生学分析,发现它们分为S1、S2、S8、S15、S17、S20和S22 7个亚组.大豆根系中MYB基因差异表达分析结果显示,镉胁迫条件下,16个R2R3-MYB基因的表达量均发生变化,且表达量变化均在2倍以上,其中6个基因表达下调,最大下调倍数达17倍,10个基因表达上调,最大上调倍数为11倍.进一步分析发现,大豆根系中的MYB基因主要通过调控重金属镉的吸收、转运、解毒过程来缓解镉的毒害作用.本研究通过对大豆根系中应答镉胁迫的R2R3-MYB基因分析,为大豆抗重金属镉育种提供基因资源和理论基础.
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文献信息
篇名 大豆根系中应答镉胁迫的R2R3-MYB基因分析
来源期刊 生态学杂志 学科
关键词 大豆根系 转录组测序 R2R3-MYB基因
年,卷(期) 2018,(7) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 2030-2039
页数 10页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13292/j.1000-4890.201807.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 丁杰 中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室 7 167 5.0 7.0
5 崔敏龙 中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室 4 16 3.0 4.0
6 张晓娜 中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室 5 43 3.0 5.0
10 朴春兰 中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室 2 10 1.0 2.0
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大豆根系
转录组测序
R2R3-MYB基因
研究起点
研究来源
研究分支
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相关学者/机构
期刊影响力
生态学杂志
月刊
1000-4890
21-1148/Q
大16开
沈阳市文化路72号
8-161
1982
chi
出版文献量(篇)
7755
总下载数(次)
30
总被引数(次)
161756
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