小鼠脑缺血再灌注损伤不同时间点基因表达谱的变化研究

• 作者: 吴春荣 尹雪 杨春辉 邵贵强
• 来源期刊: 神经损伤与功能重建
• 学科: 医学
• 关键词: 脑缺血 再灌注损伤 基因表达 Timp1 Gpr84
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 487-491
• 页数: 5页
• 分类号: R741|R741.02|R743
• 字数: 3806字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16780/j.cnki.sjssgncj.2018.10.001

摘要

目的:通过生物信息学方法研究小鼠脑缺血再灌注损伤(CIRI)所致的损伤模型的基因表达谱变化,寻找疾病相关的关键基因.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)中下载关于小鼠脑损伤GSE23160时间序列基因表达谱芯片的原始数据,分析皮质脑组织样本和纹状体脑组织样本在缺血再灌注不同时间点基因表达谱的差异,并对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析.再通过聚类分析挑取表达趋势明显的差异基因进行免疫细胞浸润分析和关键基因分析.并在大鼠CIRI模型上对显著差异基因进行验证.结果:免疫细胞浸润分析发现CIRI过程中出现肥大细胞和巨噬细胞浸润.CIRI过程中的差异基因主要参与愈伤反应、炎性反应和信号转导通路等.在2个组织样本的不同再灌注时间点Timp1和Gpr84基因表达都发生了显著上调.大鼠CIRI模型进一步验证了Timp1和Gpr84基因的上调表达.结论:Timp1和Gpr84基因可能是脑缺血再灌注过程中的关键基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨春辉	复旦大学附属上海市第五人民医院创伤急救危重症医学中心	16	62	5.0	7.0
2	吴春荣	复旦大学附属上海市第五人民医院创伤急救危重症医学中心	9	32	4.0	5.0
3	尹雪	复旦大学附属上海市第五人民医院创伤急救危重症医学中心	2	5	1.0	2.0