基于Ion Torrent PGMTM测序平台的CSF1PO和D18S51基因座分析

• 作者: 平原 杨仪尊
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医遗传学 序列分析,DNA CSF1PO D18S51 二代测序 IonTorrentPGMTM测序系统
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与应用
• 页码范围: 520-525
• 页数: 6页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 3730字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2018.05.017

摘要

目的 应用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术对CSF1PO和D18S51基因座进行分析检测,研究CSF1PO和D18S51基因座的序列多态性.方法 采集165例中国汉族无关个体外周血样,应用QIAamp DNA Mini试剂盒提取样本DNA,Ion Plus Fragment Library试剂盒构建文库,在Ion Torrent PGMTM测序平台上进行DNA序列测定,针对新发现的等位基因进行Sanger测序验证.应用Torrent SuiteTM v5.0.2和Integrative Genomics Viewer软件分析数据,进行基因型鉴定和频率统计,运用PowerState v12软件对数据进行统计学处理.结果 应用NGS技术同时获得了CSF1PO和D18S51基因座长度多态性和序列多态性,在CSF1PO基因座中,发现了1个新的基因型,在D18S51基因座中,发现2个新的基因型.采用Sanger测序法对NGS技术检测新发现的等位基因进行验证,验证结果一致.结论 应用二代测序技术可检测CSF1PO和D18S51基因座核心重复序列的结构,提高基因座的识别效能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨仪尊	复旦大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
5	平原	上海市公安局物证鉴定中心法医物证学现场应用技术公安部重点实验室上海市现场物证重点实验室	9	36	4.0	5.0