异养氨氧化细菌基因组DNA的检测方法比较

• 作者: 任灵玲 刘灵芝 卢洁 李梓彤 杨帅 衣珊漪 顾宗润
• 来源期刊: 土壤通报
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA提取 Qubit方法 16S rDNA-PCR 氨氧化细菌
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1355-1360
• 页数: 6页
• 分类号: Q939.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.19336/j.cnki.trtb.2018.06.13

摘要

氨氧化细菌是参与土壤氮素循环的重要微生物类群之一,其基因组DNA提取质量的准确分析,可直接影响后续分子实验的可行性和精确性.本试验针对3株异养氨氧化细菌的纯培养菌株,应用琼脂糖凝胶电泳、微量紫外分光光度计和Qubit荧光计分别检测不同提取方法获得的基因组DNA的浓度,同时结合细菌通用引物扩增16S rDNA全长来判定提取DNA的质量,进而筛选出可用于检测可培养氨氧化细菌基因组DNA浓度的方法.研究结果表明,针对不同浓度的DNA样品,尽管3种检测方法获得的结果表现出明显差异,但在16S rDNA-PCR中均仍能获得良好的扩增结果.与微量紫外分光光度法相比,Qubit方法对基因组DNA浓度的检测结果更为精确,特别在低浓度DNA检测中,能够较真实的反映基因组DNA的实际情况.