基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
水稻斑点叶突变体Spl34是自然获得的突变体,在研究其形态学和生理生化等方面的基础上,利用粳稻Francis和Spl34杂交构建F2基因定位群体进行精细定位研究,遗传分析表明Spl34的斑点叶表型受单个显性基因Spl34(t)调控;利用SSR/InDel标记对无斑点叶隐性单株进行连锁分析,将Spl34(t)精细定位于第11号染色体23.483~23.530 Mb之间,定位区间长度为46.99 kb,筛选出8个候选基因.另外,利用高通量测序技术对F2(Francis/Spl34)有斑点个体混合池、无斑点个体混合池以及双亲进行重测序,利用基因组SNP对有斑点和无斑点混合池进行关联分析,将Spl34(t)定位于第11号染色体23.223~23.791 Mb之间,区间大小约568 kb;进一步利用单分子测序技术对Spl34突变体进行测序,通过从头组装、关联分析,在两个重叠群tig00001409和tig00003011检测到紧密连锁.通过对两个重叠群之间序列进行Sanger测序并产生的新重叠群长度达到233.95 kb,其中Spl34(t)定位区间大小约40 kb.将斑点叶基因Spl34(t)精细定位于第11号染色体约40 kb的区间,为进一步开展该基因的功能研究奠定了良好基础.
推荐文章
基于高通量测序开发玉米高效KASP分子标记
玉米
重测序
KASP标记
种质资源
高通量测序及其在分子诊断领域的应用
DNA测序技术
高通量测序
分子诊断
基因
基于高通量测序的大麦InDel标记开发及应用
大麦
重测序
InDel标记
品种鉴定
基于454 GSFLX高通量测序的芒果微卫星标记特征分析
芒果
454 GSFLX高通量测序
SSR标记
文库构建法
多态性
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 基于分子标记和高通量测序的基因精细定位
来源期刊 广东农业科学 学科 农学
关键词 水稻斑点叶突变体 分子标记 高通量测序 基因定位 序列比对
年,卷(期) 2018,(10) 所属期刊栏目 作物栽培·遗传育种
研究方向 页码范围 1-8,封2
页数 9页 分类号 S511.01|Q343.1+7
字数 6033字 语种 中文
DOI 10.16768/j.issn.1004-874X.2018.10.001
五维指标
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (423)
共引文献  (256)
参考文献  (22)
节点文献
引证文献  (2)
同被引文献  (7)
二级引证文献  (1)
1900(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1949(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1977(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
1987(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1988(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1990(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1991(4)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(3)
1992(4)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(4)
1994(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1995(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1996(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
1997(11)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(11)
1998(7)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(7)
1999(8)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(8)
2000(9)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(9)
2001(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
2002(17)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(17)
2003(18)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(18)
2004(23)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(23)
2005(21)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(21)
2006(10)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(8)
2007(20)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(20)
2008(28)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(28)
2009(26)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(24)
2010(61)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(59)
2011(73)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(71)
2012(32)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(29)
2013(16)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(14)
2014(21)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(21)
2015(9)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(6)
2016(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2017(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2018(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
2019(2)
  • 引证文献(2)
  • 二级引证文献(0)
2020(1)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
水稻斑点叶突变体
分子标记
高通量测序
基因定位
序列比对
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东农业科学
月刊
1004-874X
44-1267/S
大16开
广州市五山广东省农科院内
46-43
1965
chi
出版文献量(篇)
14242
总下载数(次)
17
总被引数(次)
80868
论文1v1指导