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肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定
肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定
作者:
叶丽云
吴小平
孟国良
程冰
解凡
赵丽丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
野生肺形侧耳
线粒体基因组
多态性
种内鉴定
摘要:
线粒体是能量转化与ATP形成的重要场所,已有多种食用真菌的线粒体基因组被相继组装注释,但肺形侧耳的线粒体基因组鲜有报道.本研究对野生肺形侧耳X2菌株的线粒体基因组进行组装并注释,由野生菌株X2与主栽菌株JX线粒体大片段差异序列,构建分子标记来鉴别野生和主栽肺形侧耳菌株.结果显示X2的线粒体基因组为大小75 709bp的闭合环状结构,含有rRNA的大小亚基基因,25个负责携带氨基酸的tRNA基因以及14个常见蛋白编码基因,在cox1基因上含有9个内含子.内含子主要为IB型,包含LAGLIDADG_1 superfamily、GIy-yIG_Cterm superfamily保守结构域.位于菌株X2与JX内含子和基因间区上的大片段差异序列,是造成种内线粒体多态性的主要因素.根据两菌株的差异片段构建系统进化树的结果显示,内含子、rnl-trnX、trnD-atp6序列能够将两株野生菌株和其他主栽菌株区分开,可用于野生肺形侧耳种内鉴定,而且trnD-atp6效果最佳.
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文献信息
篇名
肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定
来源期刊
菌物学报
学科
关键词
野生肺形侧耳
线粒体基因组
多态性
种内鉴定
年,卷(期)
2018,(9)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1179-1187
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.180081
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
吴小平
福建农林大学菌物研究中心
63
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2
叶丽云
福建农林大学菌物研究中心
13
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解凡
福建农林大学菌物研究中心
4
5
2.0
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程冰
福建农林大学菌物研究中心
5
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2.0
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孟国良
福建农林大学菌物研究中心
6
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赵丽丽
福建农林大学菌物研究中心
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研究去脉
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菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
总被引数(次)
34143
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