鳞翅目基因组ⅡB型内切酶位点的统计分析

• 作者: 戴建青 陈大嵩 韩诗畴
• 来源期刊: 环境昆虫学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鳞翅目 ⅡB型内切酶 基因组 预测 统计
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 894-900
• 页数: 7页
• 分类号: Q963|S433.4
• 字数: 3498字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0858.2018.04.21

摘要

ⅡB型限制内切酶能够识别并切割特异酶切位点两端特定距离的DNA,形成粘性末端的30 bp左右的等长DNA片段.利用其特性与限制性酶切位点关联测序技术(RAD)相结合发展出2b-RAD简化基因组测序技术,应用于遗传图谱构建、种群遗传结构分析、性状定位以及细菌分型等多种研究领域.构建2b-RAD测序文库之前,需要对基因组中的ⅡB型限制内切酶位点进行预测与统计分析,制定有效的测序文库构建方案.本文利用Python语言构建分析基因组中ⅡB型限制内切酶位点的流程,预测并统计6个鳞翅目代表物种基因组含有的8个商业化ⅡB型限制内切酶的酶切位点,比较了各个基因组与ⅡB型限制内切酶之间含有的酶切位点总量、重复序列数量以及酶切间隔长度的关系,为在昆虫基因组中进一步试行2b-RAD研究提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈大嵩		3	0	0.0	0.0
2	戴建青		3	0	0.0	0.0
3	韩诗畴		2	0	0.0	0.0