比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

• 作者: 成斌 胡从从 许伟 贺学礼 赵丽莉
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: AM真菌 形态学方法 二代测序 群落结构和多样性 荒漠生境
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1170-1178
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.180072

摘要

采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性.结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属.AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著.与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺学礼	河北大学生命科学学院	200	2820	28.0	40.0
2	赵丽莉	河北大学生命科学学院	60	1009	19.0	29.0
3	胡从从	河北大学生命科学学院	6	29	3.0	5.0
4	许伟	河北大学生命科学学院	8	66	5.0	8.0
5	成斌	河北大学生命科学学院	5	10	2.0	3.0