儿童肾上腺皮质癌表达谱时序分析用于筛选相关靶点的研究

• 作者: 刘戈力 李笑各 王书焕 韩媛媛
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 肾上腺皮质肿瘤 基因表达调控,肿瘤 肿瘤标记,生物学 GEO 生存分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 细胞与分子生物学
• 页码范围: 916-922,后插2
• 页数: 8页
• 分类号: R725.86
• 语种: 中文
• DOI: 10.11958/20180333

摘要

目的 探讨肾上腺皮质癌(ACT)潜在致病机制,并筛选出可能作为相关生物靶标的基因.方法 从基因表达数据库Gene Expression Omnibus (GEO)中选取儿童ACT相关RNA芯片数据集(GSE75415),利用R语言的相关函数包对其中的18个ACT组织样本(实验组)以及7个正常肾上腺皮质组织样本(对照组)中的mRNA表达数据进行预处理差异表达分析,对ACT各分级(stage1～4)的差异表达基因(DEGs)和重合差异基因(OLDEGs),采用功能富集分析(GO功能富集和KEGG通路),并筛选出中心基因.同时对TCGA数据库包括79个ACT样本的二代测序数据进行分析,筛选出对ACT患者生存时间有影响的基因.结果 Stage1～4分别有248、334、315和561个基因发生了差异表达,各分级样本组间存在73个重合基因(OLDEGs),中心基因HSPA13、GARS、STXBP1、AKIRIN1、TUBB3在各分级中均表达上调,中心基因ADH1B、DCN、RASSF2、PDGFRA、PLAT、C3、FOS在各分级中均表达下调,它们通过影响免疫反应、细胞周期、磷酸化、凝血及相应的信号通路,对ACT的发生与发展发挥作用.另外,OLDEGs在79个TCGA数据库ACT样本生存期分析发现,基因XPO1、RACGAP1、PDGFD、NR4A2、MXRA5、VPS51、TMED3、NDFIP1和CDKN1C与ACT的生存期密切相关.结论 在各级中均差异表达的基因和生存期相关基因可以作为ACT治疗的新靶点,这将有助于进一步理解肾上腺皮质癌的病因和预后治疗.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘戈力		111	640	12.0	17.0
2	韩媛媛	天津医科大学研究生院	6	16	3.0	4.0
4	王书焕		2	6	1.0	2.0
5	李笑各		2	2	1.0	1.0