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摘要:
通过西葫芦转录组测序,筛选得到1条功能注释为过氧化物酶(peroxidase,POD)的基因全长序列(c47620.graph_ c0).分析发现,该序列全长1 245 bp,包含1个996 bp的开放读码框(open reading frame,ORF),预测编码331个氨基酸,理论分子量(molecular weight,Mw)为35.70 kDa,等电点(isoelectric point,pI)为5.40,编码的蛋白质与黄瓜、甜瓜和苦瓜等常见瓜果类蔬菜同源蛋白质的相似性在84%、84%和81%,显示其高度的保守性,基因命名为CpPOD1,GenBank登录号为MF988285.荧光定量PCR分析结果表明,CpPOD1基因具有组织表达特异性,在叶片中表达丰度最高,其次为根,在花中的表达最低.CpPOD1基因在低温弱光条件下,其表达量随时间增加而显著上调.初步推测,CpPOD1基因在西葫芦低温弱光胁迫下存在一定上调表达,猜测可能参与调控下游基因对低温弱光胁迫的响应有关.
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文献信息
篇名 西葫芦过氧化物酶POD1基因的分离及表达分析
来源期刊 福建农业学报 学科 农学
关键词 西葫芦 过氧化物酶 转录组测序 荧光定量PCR
年,卷(期) 2018,(9) 所属期刊栏目 园艺科学
研究方向 页码范围 943-949
页数 7页 分类号 S642
字数 4960字 语种 中文
DOI 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.09.010
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西葫芦
过氧化物酶
转录组测序
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期刊影响力
福建农业学报
月刊
1008-0384
35-1195/S
大16开
福建省福州市五四路247号省农科院大楼
34-56
1986
chi
出版文献量(篇)
3518
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