西葫芦过氧化物酶POD1基因的分离及表达分析

• 作者: 刘建汀 朱海生 林碧英 温庆放 王彬 黄丽芳
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西葫芦 过氧化物酶 转录组测序 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 943-949
• 页数: 7页
• 分类号: S642
• 字数: 4960字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.09.010

摘要

通过西葫芦转录组测序,筛选得到1条功能注释为过氧化物酶(peroxidase,POD)的基因全长序列(c47620.graph_ c0).分析发现,该序列全长1 245 bp,包含1个996 bp的开放读码框(open reading frame,ORF),预测编码331个氨基酸,理论分子量(molecular weight,Mw)为35.70 kDa,等电点(isoelectric point,pI)为5.40,编码的蛋白质与黄瓜、甜瓜和苦瓜等常见瓜果类蔬菜同源蛋白质的相似性在84％、84％和81％,显示其高度的保守性,基因命名为CpPOD1,GenBank登录号为MF988285.荧光定量PCR分析结果表明,CpPOD1基因具有组织表达特异性,在叶片中表达丰度最高,其次为根,在花中的表达最低.CpPOD1基因在低温弱光条件下,其表达量随时间增加而显著上调.初步推测,CpPOD1基因在西葫芦低温弱光胁迫下存在一定上调表达,猜测可能参与调控下游基因对低温弱光胁迫的响应有关.