小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯 作用的分子模拟

• 作者: 李玉华 杨宗渠 杨玉珍 赵奇 邓培渊 雷志华
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 小菜蛾 性信息素结合蛋白(PxylPBP2) 性信息素 分子动力学模拟 能量分解
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 2193-2197
• 页数: 5页
• 分类号: S433.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.11.11

摘要

[目的]研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14:Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据.[方法]运用YASARA对PxylPBP2进行同源建模,运用AutoDock 4.2进行PxylPBP2与Z9-14:Ac的空间结构对接,运用YASARA平台进行分子动力学模拟,运用MMPBSA.py模块计算PxylPBP2-Z9-14:Ac复合物的结合自由能,以Amber 12软件包描述结合关键氨基酸,分析PxylPBP2与Z9-14:Ac的结合模式及相互作用力.[结果]同源建模构建了合理的PxylPBP2空间模型,分子对接结果表明Z9-14:Ac结合于PxylPBP2结合腔的内部,受体配体间无氢键,1.4 ns时对接复合物收敛平衡;PxylPBP2-Z9-14:Ac结合自由能为-9.76 kcal/mol;Phe22和Ile104的贡献能量和占总结合自由能的43％.[结论]范德瓦斯力和非极性溶剂力是PxylPBP2与Z9-14:Ac形成稳定复合物的主要内驱力,能量贡献最大的两个关键氨基酸(Phe22和Ile104)位于侧链上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨宗渠	郑州师范学院生命科学学院	13	49	5.0	6.0
2	邓培渊	郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室	14	31	2.0	5.0
3	杨玉珍	郑州师范学院生命科学学院	101	826	15.0	25.0
4	赵奇	郑州师范学院生命科学学院	39	68	5.0	5.0
5	雷志华	郑州师范学院生命科学学院	35	99	5.0	9.0
6	李玉华	郑州师范学院生命科学学院	28	41	4.0	5.0