杉木木糖合成酶基因ClUAXS2的全长克隆与分析

• 作者: 张颖 李明 苏烁烁 陈冉红 陈婉婷 马祥庆
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 杉木 ClUAXS2 木糖合成酶 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 林木遗传育种与培育
• 页码范围: 82-90,143
• 页数: 10页
• 分类号: S791.27
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2018.03.13

摘要

木糖合成酶UAXS基因是植物体内调控细胞壁中UDP-D-葡萄糖醛酸脱羧反应生成UDP-D-木糖/芹菜糖的关键性核苷糖合成酶,对植物细胞壁多糖物质的稳定合成和转换有重要意义.从杉木转录组中挑选获得木糖合成酶基因UAXS的中间序列,使用全长克隆技术和PCR技术克隆得到1个杉木木糖合成酶基因ClUAXS2.结果表明,ClUAXS2基因全长为1 753 bp,包含的1 158 bp的开放阅读框,可编码长度为386个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白质分子式为C1936H3026N524O578S19,分子质量为43.90 ku,等电位点为5.60.ClUAXS2基因为亲水性蛋白,没有信号肽结构域,编码1个疑似跨膜区域.蛋白质二级结构分析表明其蛋白主要骨架为Loop环和a-螺旋,预测亚细胞定位于细胞质中.通过对比分析发现ClUAXS2基因属于UAXS家族基因,编码1个UDP-D-Apiose/ UDP-D-Xylose synthase 2 (UAXS2)木糖酶蛋白.进化树分析结果显示,杉木ClUAXS2基因与无油樟(AtUAXS2)和可可树(TcUAXS2)的氨基酸序列相似度达到85％、86％,与拟南芥(AtAXS2),葡萄(VvUAXS)、毛果杨(PtAXS1)的氨基酸序列相似度为84％.实时荧光定量PCR结果表明,ClUAXS2基因在杉木的根、茎、叶中均有表达,但在1年生杉木幼苗茎中的表达量最高;ClUAXS2基因在不同杉木无性系茎中的表达量差异不显著,在根和叶中的表达量存在差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李明	福建农林大学林学院	112	298	9.0	10.0
3	马祥庆	福建农林大学林学院	142	2783	30.0	48.0
5	张颖	福建农林大学林学院	37	60	4.0	6.0
10	陈冉红	福建农林大学林学院	6	6	1.0	2.0
11	苏烁烁	福建农林大学林学院	5	30	3.0	5.0
12	陈婉婷	福建农林大学林学院	6	6	1.0	2.0