金针菇HMG-box转录因子鉴定及一个候选基因的差异表达分析

• 作者: 丑天胜 刘芳 孟丽 王丽 王威 谢宝贵
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 金针菇 原基形成 高速泳动蛋白 转录因子
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 466-475
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.170179

摘要

食用菌的原基形成受到环境因子和内源基因的共同调控,转录因子在其生长发育过程中能够起到关键作用.本研究在已测序金针菇单核菌株L11全基因组中鉴定到29个高速泳动蛋白(high-mobility-group box,HMG-box)转录因子编码基因.基于金针菇双核菌株H1123各发育时期转录组数据,筛选到一个与金针菇原基形成相关的HMG-box转录因子基因Fv-hmg.通过同源比对发现Fv-hmg的DNA序列在6个不同金针菇菌株中十分保守,一致性为98.38％,有92个SNP位点.克隆分析表明,该基因长度为1 517bp,含有一个内含子.该基因编码489个氨基酸残基的蛋白序列,含有一个HMG-box结构域.通过实时荧光定量PCR和转录组测序共同分析表明,该基因在金针菇原基时期的表达量比双核菌丝时期高达4倍以上,具有显著性差异(P＜0.01),由此推测该转录因子参与调控金针菇的原基形成.HMG-box转录因子Fv-Hmg在金针菇原基形成过程中的作用仍需进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢宝贵	福建农林大学菌物研究中心	186	1536	20.0	28.0
2	王丽	山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室	26	282	9.0	16.0
3	刘芳	福建农林大学菌物研究中心	27	189	9.0	12.0
4	孟丽	山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室	14	404	6.0	14.0
5	丑天胜	福建农林大学菌物研究中心	6	20	3.0	4.0
6	王威	山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室	3	3	1.0	1.0