三个远交系豚鼠微卫星遗传结构分析

• 作者: 刘迪文 卫振 谭海明 陈雁虹
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 豚鼠 远交系 微卫星标记 遗传多态性 种群差异位点
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 81-88
• 页数: 8页
• 分类号: R-33
• 字数: 4750字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2018.11.014

摘要

目的 评估我校培育的三个远交系豚鼠种群的微卫星遗传结构,筛选不同种群间呈现差异等位基因的微卫星位点,为今后豚鼠遗传育种及应用提供资料.方法 使用45对引物通过PCR及电泳技术,对我校三个豚鼠种群的微卫星DNA进行扩增分析,计算各位点等位基因多态性等参数,并筛选出种群间等位基因呈差异变化的微卫星位点.结果 所有微卫星位点在豚鼠种群中呈多态性变化,各位点等位基因数2～7不等,平均位点基因数2.29,平均有效基因数1.74;平均期望杂合度为0.39,平均观测杂合度为0.21,多态信息含量的可信范围为0.0739～0.6443,平均PIC为0.32,68.9％ 的位点呈中度多态性;总Hardy-Weinberg平衡P值平均为0.1734,各种群均为P>0.05,但对每个位点的基因平衡状态来讲,共有20个位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡,种群平均偏离指数D为-0.407;平均分化指数Fst为0.136,平均基因流Nm为5.835,还阐明了种群间的Nei遗传距离及遗传相似度.结论 三个豚鼠种群遗传呈中度多态性变化,种群间平均遗传差异无显著性,遗传相似度较高.群体遗传偏离Hardy-Weinberg平衡较突出,出现严重的近交现象,群体处于中等遗传变异水平,但较高的基因流动阻止了遗传分化发生.分析这些问题的原因,主要是本群体繁殖数量偏小,种子选择范围不广泛等,今后在培育过程中要引起重视.本课题还筛选到与不同种群或毛色豚鼠相关的微卫星位点12个,种群特征性微卫星位点7个,可能用于性状基因定位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈雁虹	浙江大学实验动物中心	11	42	4.0	6.0
2	刘迪文	浙江大学实验动物中心	26	83	5.0	7.0
3	卫振	浙江大学实验动物中心	18	126	7.0	10.0
4	谭海明	浙江大学实验动物中心	2	0	0.0	0.0