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稻—稻—油菜轮作土壤细菌群落的特征
稻—稻—油菜轮作土壤细菌群落的特征
作者:
丁鑫
廖健程
张立成
彭沛宇
肖卫华
胡德勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
轮作
连作
16S rDNA
土壤细菌群落
克隆文库
摘要:
为了解南方地区稻-稻-油菜轮作后土壤中细菌群落的变化特征,以长达30年的水稻-水稻-油菜轮作和水稻-水稻连作定点栽培试验土壤为研究对象,采用克隆文库和基因序列分析法,通过细菌16S rDNA基因通用引物对土壤提取DNA进行PCR扩增,然后将扩增片段构建克隆文库对克隆子进行测序分析. 结果显示,2015年7月、10月和2016年4月3次取样中轮作土壤细菌的香农-维纳指数和辛普森指数均高于连作土壤,轮作土壤细菌多样性高于连作. 克隆子序列OTU与GenBank比对结果显示,轮作土壤中常见的变形菌(Proteobacteria)占细菌种类的55%,连作土壤为45%;轮作土壤芽单胞菌(Gemmatimonadetes)占细菌种类的13%,连作土壤为10%;轮作土壤中的酸杆菌(Acidobacteria)、厚壁菌(Firmicutes)和浮霉菌 (Planctomycetes)所占细菌比例数小于连作土壤;变形菌和芽单胞菌构成了轮作土壤中的优势菌群,土壤优势菌群的变化对细菌群落结构特征产生影响. 测序结果显示稻-稻-油菜轮作土壤优势菌群中α-变形菌、β-变形菌和γ-变形菌高于稻-稻连作;稻-稻-油菜轮作中发现与绿弯菌(Chloroflexi)序列相似菌类,而稻-稻连作土壤中未发现. 本研究表明微生物群落结构组成与土壤耕作方式相关,稻-稻-油菜轮作增加了细菌群落丰度. (图3 表2 参20)
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稻—稻—油菜轮作土壤细菌群落的特征
来源期刊
应用与环境生物学报
学科
农学
关键词
轮作
连作
16S rDNA
土壤细菌群落
克隆文库
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
276-280
页数
5页
分类号
Q93-3|S154.3
字数
语种
中文
DOI
10.19675/j.cnki.1006-687x.2017.06014
五维指标
作者信息
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1
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丁鑫
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廖健程
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彭沛宇
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应用与环境生物学报
主办单位:
中国科学院成都生物研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1006-687X
CN:
51-1482/Q
开本:
大16开
出版地:
成都市人民南路4段9号
邮发代号:
62-15
创刊时间:
1995
语种:
chi
出版文献量(篇)
3881
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