猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析

• 作者: 张亮 张廷焕 柴捷 王金勇 蓝静 赵久刚 郭宗义 龙熙
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 猪 真核翻译起始因子2(eIF2) EIF2S3基因 克隆 序列分析 组织表达谱
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 2062-2069
• 页数: 8页
• 分类号: S828.89
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.10.24

摘要

[目的]克隆猪EIF2S3基因mRNA全长,并进行生物信息学分析及检测其在猪各组织中的表达特征,为研究真核翻译起始因子2(eIF2)蛋白γ亚基的生物学功能打下基础.[方法]以荣昌猪胸腺mRNA为模板,采用RCAE-PCR克隆EIF2S3基因的mRNA全长序列,在线完成各种生物信息学分析后,利用实时荧光定量PCR分析猪EIF2S3基因的组织表达特征.[结果]猪EIF2S3基因mRNA全长1813 bp,其中蛋白质编码区(CDS)长1419 bp,5'UTR区、3'UTR区分别长14和380 bp,编码472个氨基酸.EIF2S3蛋白分子量51.1 kD,理论等电点(pI)8.62,包含58个带正电的氨基酸和52个带负电的氨基酸,其前体蛋白靠近N端区域有一个强疏水区;EIF2S3蛋白的空间结构由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成.EIF2S3蛋白氨基酸序列与狗和大白鼠的相似性最高(99.6％),其次是马、猫、牛、羊和人类(99.4％),与斑马鱼的相似性最低(96.6％).EIF2S3基因在猪的心脏、胸腺和淋巴组织中表达量较高,在脾脏和肌肉中呈中度表达,在肾脏中的表达量较低,而在肝脏中基本不表达.[结论]猪EIF2S3基因全长1813 bp,在核酸和氨基酸水平上与其他物种的EIF2S3基因高度同源,尤其与狗和大白鼠的遗传距离最近;其在猪心脏、胸腺和淋巴组织中的表达量较高,在肝脏中基本不表达,据此推测EIF2S3参与合成的蛋白更多地参与心脏泵血和免疫相关功能,基本不发挥能量代谢功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王金勇		60	362	10.0	16.0
2	郭宗义		48	61	5.0	6.0
3	张亮		18	43	3.0	6.0
4	蓝静		5	15	2.0	3.0
5	龙熙		10	9	2.0	2.0
6	张廷焕		8	14	2.0	3.0
7	赵久刚		6	5	2.0	2.0
8	柴捷		15	10	2.0	2.0