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摘要:
目的:植物乳杆菌FMNP01是从新鲜热带芒果中分离获得的一株具有较好抗菌活性的乳酸菌.为深入研究其内在抗菌机理,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息.方法:采用高通量测序技术对植物乳杆菌FMNP01进行全基因组测序,采用生物信息学方法对其进行序列组装、基因预测与功能注释,并深入挖掘其细菌素合成相关基因簇信息.结果:通过基因组组装共得到18个重叠群,整个基因组大小为3 313 644 bp,GC含量44.48%.将序列提交至GenBank数据库,登陆号为JPSU00000000.在其基因组中发现一段细菌素合成相关基因簇.结论:本研究结果揭示了植物乳杆菌FMNP01抑菌机理,为其功能基因组学研究提供了理论依据.
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文献信息
篇名 芒果源植物乳杆菌FMNP01的全基因组测序及序列分析
来源期刊 中国食品学报 学科
关键词 植物乳杆菌 全基因组测序 抗菌活性
年,卷(期) 2018,(5) 所属期刊栏目 分析与检测
研究方向 页码范围 232-238
页数 7页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.16429/j.1009-7848.2018.05.027
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 林俊芳 华南农业大学食品学院食品生物技术研究所 95 904 18.0 26.0
3 郭丽琼 华南农业大学食品学院食品生物技术研究所 94 847 17.0 26.0
5 刘英丽 北京工商大学食品质量与安全北京实验室 24 147 7.0 11.0
6 李雪飞 华南农业大学食品学院食品生物技术研究所 1 0 0.0 0.0
12 叶志伟 华南农业大学食品学院食品生物技术研究所 11 6 1.0 2.0
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研究主题发展历程
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植物乳杆菌
全基因组测序
抗菌活性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国食品学报
月刊
1009-7848
11-4528/TS
16开
北京市海淀区阜成路北3街6号轻苑大厦3层
2001
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