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石斛小菇促进天麻种子萌发的转录组研究
石斛小菇促进天麻种子萌发的转录组研究
作者:
凌鸿
张盈
曾旭
杨建文
郭顺星
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
转录组
种子萌发
天麻
寡糖激发子
摘要:
天麻Gastrodia elata种子细小而无胚乳,自然条件下需要石斛小菇Mycena dendrobii等真菌共生来完成种子萌发和生长.为了探讨天麻种子接菌萌发过程中的基因表达变化,本研究利用高通量RNA测序技术,对共生真菌石斛小菇、天麻成熟种子以及接菌萌发后的天麻原球茎进行比较分析,共获得42 263条注释unigenes,并筛选到5 409条差异表达基因.GO分析表明,差异表达基因主要参与代谢、离子结合等生物学通路中.KEGG功能富集分析结果表明,差异基因参与了植物激素信号传导、碳代谢、苯丙素生物合成、淀粉与蔗糖代谢以及氨基酸生物合成中.真菌和植物细胞壁多糖经降解产生的寡糖激发子,可以诱导宿主产生多种防御反应,参与到宿主与真菌互作中.在共生萌发过程中,真菌细胞壁降解相关基因的表达显著提高,如几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶基因表达甚至上调了20倍之多.此外,植物细胞壁木聚糖酶和果胶酶基因表达显著升高.这类基因表达可释放寡糖激发子,在天麻种子对石斛小菇的防御过程中起到重要的作用.本文全面分析天麻种子接菌萌发前后基因表达变化,为进一步研究天麻重要功能基因的功能鉴定提供基础.
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篇名
石斛小菇促进天麻种子萌发的转录组研究
来源期刊
菌物学报
学科
关键词
转录组
种子萌发
天麻
寡糖激发子
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
52-63
页数
12页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.170197
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
郭顺星
中国医学科学院药用植物研究所
146
2845
28.0
48.0
2
凌鸿
中国医学科学院药用植物研究所
5
14
2.0
3.0
3
曾旭
中国医学科学院药用植物研究所
12
49
4.0
7.0
4
杨建文
中国医学科学院药用植物研究所
3
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2.0
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张盈
中国医学科学院药用植物研究所
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天麻
寡糖激发子
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
总被引数(次)
34143
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