基于EST和GSS序列的茶树miRNA及其靶基因数据挖掘

• 作者: 张玥 房婉萍 柯子星 熊飞 胡雲飞
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: microRNA 茶树 EST GSS 靶基因
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1999-2006
• 页数: 8页
• 分类号: S571.1
• 字数: 4622字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.10.016

摘要

microRNA(miRNA)是一类长19～24个碱基的小分子内源性非编码单链RNA,通过介导靶基因的裂解或抑制靶基因的翻译,在植物的发育、新陈代谢、应激响应等方面起着重要的调控作用,在进化上具有高度的保守性.据此本研究以miRBase注册的全部成熟植物miRNA序列为探针,基于NCBI数据库中茶树表达序列标签(EST)和基因组勘测序列(GSS)进行同源搜索和miRNA二级结构分析,总共发现7条茶树的miRNA,分属于6个不同的miRNA家族.通过靶基因的预测分析表明,这些miRNA可能调节28种靶标基因,功能涉及新陈代谢、生长发育、胁迫应答及转录,为茶树miRNA的试验鉴定和功能研究提供更详细精确的范围,为进一步探究茶树miRNA的调控机理奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	房婉萍	南京农业大学茶叶科学研究所	49	498	13.0	20.0
2	张玥	福建农林大学安溪茶学院	12	6	2.0	2.0
3	胡雲飞	福建农林大学安溪茶学院	4	3	1.0	1.0
4	柯子星	福建农林大学安溪茶学院	6	1	1.0	1.0
5	熊飞	南京农业大学茶叶科学研究所	1	0	0.0	0.0