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转移性喉鳞状细胞癌组织中长链非编码RNA的筛选及鉴定
转移性喉鳞状细胞癌组织中长链非编码RNA的筛选及鉴定
作者:
曹欢
杨建旺
池伟伟
王宝山
蒋新霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
转移性喉鳞状细胞癌
长链非编码RNA
差异表达
基因芯片
摘要:
目的:应用高通量基因芯片技术进行转移性喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的筛选及鉴定,寻找有价值的LSCC相关候选基因和分子标志物.方法:4例LSCC组织标本均来自河北医科大学耳鼻咽喉头颈外科生物样本库,病理证实为淋巴结转移的LSCC组织及癌旁黏膜组织.提取标本组织总RNA后,应用SBC-lncRNA基因芯片检测差异表达的lncRNA及mRNA,采用差异倍数以及Student'st法对差异表达基因进行筛选,将差异倍数(linear)≤ 0.5或者≥2.0和P< 0.05判断为差异表达基因.选取特定的差异表达lncRNA,应用qRT-PCR技术验证芯片结果的可靠性.结果:通过对转移性LSCC组织和癌旁组织的lncRNA表达谱分析显示,转移性LSCC组织与癌旁组织的lncRNA表达谱存在明显差异,差异表达的lncRNA3 073个,其中癌组织中表达上调1 967个、下调1 106个;差异表达的mRNA2 809个,其中癌组织中表达上调1 791个、下调1 018个.差异表达的lncRNA主要参与细胞增殖、凋亡及免疫应答等生物学过程,涉及细胞因子及其受体的相互作用、趋化因子信号通路、细胞周期调节、P53信号通路等.选取其中10条具有显著差异表达的lncRNA,在25例LSCC标本组织中进行qRT-PCR验证,发现表达趋势与芯片检测结果一致.结论:转移性LSCC组织及癌旁组织的lncRNA表达谱存在明显差异,深入分析这些差异表达lncRNA的分子作用机制对阐明转移性LSCC的侵袭转移机制有重要的意义,可为LSCC特异性肿瘤标志物的筛选及有效的靶向治疗提供实验依据.
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文献信息
篇名
转移性喉鳞状细胞癌组织中长链非编码RNA的筛选及鉴定
来源期刊
中国肿瘤生物治疗杂志
学科
医学
关键词
转移性喉鳞状细胞癌
长链非编码RNA
差异表达
基因芯片
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
163-169
页数
7页
分类号
R734.1|R730.4
字数
语种
中文
DOI
10.3872/j.issn.1007-385x.2018.02.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王宝山
河北医科大学第二医院耳鼻咽喉科
50
128
6.0
8.0
2
蒋新霞
河北医科大学第二医院耳鼻咽喉科
31
82
5.0
6.0
3
池伟伟
河北医科大学第一医院耳鼻咽喉科
6
21
2.0
4.0
4
曹欢
河北医科大学第二医院耳鼻咽喉科
2
2
1.0
1.0
5
杨建旺
河北医科大学第二医院耳鼻咽喉科
4
14
1.0
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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节点文献
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参考文献(7)
二级参考文献(3)
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参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2019(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
转移性喉鳞状细胞癌
长链非编码RNA
差异表达
基因芯片
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国肿瘤生物治疗杂志
主办单位:
中国免疫学会
中国抗癌协会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-385X
CN:
31-1725/R
开本:
大16开
出版地:
上海市杨浦区翔殷路800号
邮发代号:
4-576
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
3206
总下载数(次)
6
总被引数(次)
14465
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