油棕种壳厚度控制基因SHELL的SNP分子标记开发

• 作者: 夏薇 曹红星 李东霞 王永 石鹏 肖勇 雷新涛
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 农学
• 关键词: 油棕 种壳厚度 SHELL基因 错配碱基 SNP标记
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 重要/特色植物遗传资源及其种质创新(专栏)
• 页码范围: 195-201
• 页数: 7页
• 分类号: Q949.9|S59
• 字数: 3709字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201702002

摘要

油棕属棕榈科多年生木本油料作物,果实含油量高达50%,且单位面积产油量高,享有"世界油王"美誉.油棕果实由外果皮、中果皮、内果皮(种壳)、种子四个部分组成,产油部分主要是中果皮和种子,其中种壳厚度是影响果实含油量的重要因素.SHELL基因控制种壳厚度,是一类MADS?box同源基因,SHELL基因在厚壳种和无壳种中的变异主要是第一个外显子上的两个SNP位点.该研究根据两个SNP 位点进行特异标记开发,根据已知的油棕SHELL基因的序列,设计了4对SNP引物.4对SNP引物以2个SNP 位点设计,每个SNP位点设计2对SNP标记,并均在引物3′端第二位引入强错配碱基.以2份薄壳种油棕材料和2份厚壳种油棕材料DNA为模板,扩增筛选油棕SHELL基因SNP 引物.通过 PCR扩增发现,设计的SHELL基因特异SNP标记EgSh(N)?f/EgSh(SNP)?2r能够鉴别油棕厚壳种和薄壳种.再用24株油棕树进行特异性验证,发现该标记能较准确地判断油棕的厚薄壳.该研究结果表明 SNP 标记 EgSh(N)?f/EgSh (SNP)?2r可用来进行油棕种质资源早期分子鉴定,为高产油棕品种选育提供了技术支撑.