蜜环菌与天麻共生分子机制的转录组分析

• 作者: 包燚 张恒丽 徐慧妮 操璟璟 李昆志 谭彧文 陈丽梅
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 蜜环菌 天麻 转录组测序 基因表达 共生
• 年，卷（期）: 2018,（17）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 4125-4130
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.17.024

摘要

目的 以蜜环菌和昭通乌天麻营养繁殖茎为实验材料,通过转录组测序比较分析,初步揭示蜜环菌天麻共生的分子机制.方法 采用Trizol Reagent (Invitrogen)提取营养繁殖茎样品中的RNA,建立测序文库并进行测序.结果 蜜环菌与天麻共生时有38 838条序列得到注释,在FDR (False Discovery Rate) ＜0.05和log2 |FC|＞1筛选条件下,共有23 333条基因发生显著差异表达,其中1 595条基因呈上调表达,21 738条呈下调表达.基于转录组数据分析结果,与胞外酶纤维素酶、木聚糖酶、漆酶以及多聚半乳糖醛酸酶相关的Unigene分别有21、6、39和6个,集中差异表达基因分别有9、3、23和4个,除1个纤维素酶基因上调表达外,其他均呈下调表达;与抗氧化酶超氧化物歧化酶、过氧化物酶和过氧化氢酶有关的Unigene基因分别有13、7和17个,其中差异表达的基因分别有6、7和7个,都呈下调表达.此外,RT-qPCR分析验证了这些基因呈下调表达.结论 蜜环菌侵染天麻与其共生的过程中,蜜环菌的生命活动减弱,同时未受到天麻胁迫作用.这为进一步研究天麻蜜环菌共生分子机制提供了大量有价值的基因资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈丽梅	昆明理工大学生命科学与技术学院	99	642	14.0	18.0
2	李昆志	昆明理工大学生命科学与技术学院	73	471	13.0	16.0
3	徐慧妮	昆明理工大学生命科学与技术学院	19	122	8.0	10.0
4	包燚	昆明理工大学生命科学与技术学院	3	7	2.0	2.0
5	操璟璟	昆明理工大学生命科学与技术学院	2	5	1.0	2.0
6	张恒丽	昆明理工大学生命科学与技术学院	2	5	1.0	2.0
7	谭彧文	昆明理工大学生命科学与技术学院	1	4	1.0	1.0