云南丘北仙女虾一物种的分子鉴定

• 作者: 和忠廷 曾本娟 李春青 李蓉 杨洪福 肖蘅 陈善元 陈艳艳
• 来源期刊: 生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 仙女虾 COI基因 18SrDNA基因 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 46-51
• 页数: 6页
• 分类号: Q953
• 字数: 5050字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1736.2018.01.046

摘要

为了从分子水平上明确云南丘北仙女虾一物种的具体种类,采用PCR产物直接测序法测定了30个样本的COI基因与18S rDNA基因的部分序列片段(长度分别为658 bp和325 bp).基于NCBI数据库BLAST相似性比对发现COI基因与18S rDNA基因序列同Streptocephalus sirindhornae相似度最高,分别为96%和100%.序列分析发现COI基因序列中共检测到15个简约信息位点,22个变异位点,8个单倍型;18S rDNA基因序列中只检测到1个简约信息位点,1个变异位点,2个单倍型.此外,结合GenBank中无背甲目部分科物种的同源序列,进行遗传距离和系统发育关系分析.结果显示:丘北仙女虾与弯头虫科的S. sirindhornae种间遗传距离为4.3%,属于种内水平;与钗额虫科的Thamnocephalus platyurus种间遗传距离为21.1%,属于种间水平.此外,系统发育树显示:丘北仙女虾与S. sirindhornae聚在一起形成一个单系枝,COI树的支持率为100%,18S rDNA树的支持率为72%.上述结果表明云南丘北仙女虾是弯头虫科的Streptocephalus sirindhornae,而不是钗额虫科的物种.同时,还表明COI基因相比18S rDNA基因更适合用于仙女虾物种的分子鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖蘅	云南大学生命科学学院	26	211	7.0	13.0
2	曾本娟	云南大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
3	李蓉	云南大学生命科学学院	9	12	3.0	3.0
4	陈善元	云南大学生命科学学院	13	96	4.0	9.0
5	李春青	云南大学生命科学学院	11	18	3.0	3.0
6	陈艳艳	云南大学生命科学学院	5	8	2.0	2.0
7	和忠廷	云南大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0