大黄鱼cGAS-like基因isofrom X1的克隆鉴定及在感染刺激隐核虫后的表达变化

• 作者: 孙恺辉 洪宇建 洪宇聪 洪越群 郑利兵
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大黄鱼(Larimichthyscrocea) 刺激隐核虫(Cryptocaryonirritans) cGAS 基因鉴定 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 62-70
• 页数: 9页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4770字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759//hykx20180509002

摘要

cGAS(cyclic GMP-AMP synthase)基因是近几年来新发现的先天免疫中一个新型的信号分子.作者基于大黄鱼(Larimichthys crocea)基因组信息,用cDNA末端快速扩增(RACE)技术在鳃组织中克隆鉴定了cGAS基因cDNA全长序列:包含1个231 bp的5′端-非翻译区(5′-UTR)、207 bp的3′-UTR和1488 bp的开放阅读框(ORF),命名为Lc-cGAS-like X1.该基因编码1个由495个氨基酸残基组成的多肽,预测的分子量(Mw)大小为56.57 kDa,理论等电点(pI)为9.45;序列分析表明其预测的蛋白无信号肽,第115～431位氨基酸序列为Mab-21功能域,第470～492位氨基酸序列为跨膜结构域.基因组全长3153 bp,包含8个外显子和7个内含子,所有内含子的剪切特点都符合GT-AG规则.同源比对结果显示:Lc-cGAS-like X1与鱼类cGAS的相似性大于66％,与高等脊椎动物的相似性较低.系统进化分析表明Lc-cGAS-like X1与鱼类cGAS聚成一支.荧光定量PCR(qPCR)检测显示Lc-cGAS基因(X1/X2两种剪切体)在大黄鱼9种组织中均有表达,其中在鳃中的表达量最高;刺激隐核虫感染后,大黄鱼免疫器官头肾中Lc-cGAS mRNA分别在刺激隐核虫幼虫感染阶段和滋养体脱落阶段出现了极显著上调(P<0.01);解毒器官肝脏中分别在滋养体脱落阶段和细菌感染阶段出现极显著上调变化(P<0.01).本研究结果暗示大黄鱼cGAS基因参与了大黄鱼感染刺激隐核虫的免疫防御过程,为进一步了解鱼类cGAS基因的多样化功能提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	洪宇建		3	3	1.0	1.0
2	郑利兵		1	1	1.0	1.0
3	洪越群		4	6	2.0	2.0
4	孙恺辉		1	1	1.0	1.0
5	洪宇聪		3	3	1.0	1.0