基于公共数据库分析FABP5在肾透明细胞癌中表达及预后的意义

• 作者: 张淑芳 曹卉 高鑫 黄邓高
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 腺癌,透明细胞 自动数据处理 数据库管理系统 FABP5基因 肾透明细胞癌 Oncomine数据库 GEO数据库 DAVID数据库 GEPIA 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 细胞与分子生物学
• 页码范围: 1145-1150
• 页数: 6页
• 分类号: R737.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.11958/20180999

摘要

目的 探讨脂肪酸结合蛋白5(FABP5)基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义.方法 提取Oncomine和GEO数据库中有关FABP5的信息并进行表达情况分析,通过DAVID数据库对差异基因进行功能注释,采用GEPIA进行预后分析.结果 Oncomine数据库中共找到445项FABP5在不同肿瘤类型中的研究数据集,表达差异有统计学意义的结果中表达增高的有32项(肾癌5项),表达降低的有24项(肾癌0项).肾癌中有4项涉及肾透明细胞癌和正常组织中FABP5的表达研究数据集.综合比较这4项数据集发现,FABP5在肾透明细胞癌中的表达量高于正常组织(P＜0.05).GEO数据库中GSE66271芯片数据分析结果发现差异基因FABP5在肾透明细胞癌中的表达量显著高于正常组织(P＜0.01).DAVID功能分析发现这些差异基因主要集中于影响细胞的转运蛋白活性和蛋白质的消化和吸收代谢功能.使用GEPIA分析来自TCGA数据库和GTEx项目的516例患者预后发现FABP5高表达的患者总体死亡率较高,低表达FABP5的患者预后较好(P=0.001 1).结论 FABP5在肾透明细胞癌组织中呈现高表达,并与肾透明细胞癌预后差相关,其有望成为抗肾透明细胞癌药物的重要治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张淑芳	中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室	25	55	4.0	6.0
2	黄邓高	中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室	18	14	3.0	3.0
3	曹卉	中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室	12	13	2.0	3.0
4	高鑫	中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室	5	4	1.0	1.0