基于ITS序列的中国樱桃、欧洲甜樱桃和毛樱桃种内遗传多样性及种间关系分析

• 作者: 张静 汤浩茹 王小蓉 王浩 王燕 陈涛 陈清 黄智林
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中国樱桃 欧洲甜樱桃 毛樱桃 ITS序列 单倍型 遗传多样性 种间关系
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 126-138
• 页数: 13页
• 分类号: S662.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0317

摘要

对中国樱桃[Cerasus pseudocerasus (Lindl.)G Don](地方种质35份,野生资源35份),欧洲甜樱桃[C.avium (L.) Moench](18份)和毛樱桃[C.tomentosa (Thunb.) Wall.](7份)共95份材料的核糖体内转录间隔区(ITS,internal transcribed spacer)序列进行了测定和分析,以期从ITS的DNA序列变异角度揭示种内遗传多样性及种间遗传关系.结果表明:(1)96条ITS序列比对后长度为712bp,G+C含量为58.1％,检测到71个变异位点(9.97％),共定义了37个单倍型;中国樱桃、欧洲甜樱桃和毛樱桃的单倍型多样性和核酸多样性分别为0.840和0.00466、0.928和0.00396、0.905和0.00564,中国樱桃中栽培种质遗传多样性明显低于其野生资源;(2)种间遗传关系显示,中国樱桃与欧洲甜樱桃之间的遗传距离较近(0.019),而与毛樱桃遗传距离较远(0.048);(3)邻接聚类和单倍型网络分析显示3个种分别聚为3个分支,种间具有较大的遗传分化.同时,选择3个种的代表单倍型进行其ITS序列的二级结构预测分析,3个种之间ITS1区、ITS2区的二级结构差异较大,最小自由能差异显著,进一步揭示了3个种间的遗传关系较远.综合分析认为,3个樱桃种内均具有较高的遗传多样性,种间具有较大的遗传分化,遗传关系较远,其中毛樱桃与中国樱桃和欧洲甜樱桃的遗传关系均较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤浩茹	四川农业大学园艺学院	150	2302	23.0	42.0
5	陈涛	四川农业大学果蔬研究所	39	184	8.0	12.0
6	陈清	四川农业大学园艺学院	45	318	9.0	17.0
7	张静	四川农业大学果蔬研究所	46	354	11.0	17.0
8	王浩	四川农业大学园艺学院	4	29	2.0	4.0
9	王燕	四川农业大学果蔬研究所	34	103	5.0	9.0
10	黄智林	四川农业大学园艺学院	2	31	2.0	2.0