基于NGS技术的仔猪腹泻病毒检测

• 作者: 何启盖 周杰珑 李静 罗文涛 陈芳洲
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: NGS 猪 腹泻 病毒 PEDV PCV3
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 112-118
• 页数: 7页
• 分类号: S858.28
• 字数: 3123字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11929/j.issn.2095-1914.2018.04.018

摘要

为探究四川某猪场反复暴发仔猪腹泻的原因,利用下一代测序技术(NGS)对该猪场的仔猪肠道样品进行检测,结合常规PCR、 测序方法进行验证分析.结果表明:该猪场存在猪流行性腹泻病毒PEDV,通过对该场PEDV S1基因的进化树分析,发现该PEDV毒株属于独立的一个分支;同时还在该场病料中检测到猪圆环病毒3型(PCV3),该猪场腹泻问题可能是由于新型PEDV毒株和PCV3毒株混合感染导致.