新疆野樱桃李EST-SSR引物开发及通用性评价

• 作者: 李疆 李鹏 田嘉 盛芳 秦雪 罗淑萍 陈淑英
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 野樱桃李 EST-SSR 引物开发 PCR 通用性
• 年，卷（期）: 2018,（13）
• 所属期刊栏目: 林学·园艺·园林
• 页码范围: 76-82
• 页数: 7页
• 分类号: S662.3
• 语种: 中文

摘要

野生樱桃李是中国濒临灭绝的树种之一.本研究从分子水平对野樱桃李进行研究,以期为制定保护策略提供理论依据.从NCBI数据库中下载樱桃李EST序列,用SSR Hunter 1.3查找SSR位点,用Primer 6.0设计了30对引物并验证引物的通用性.结果表明:有20对引物能扩增出有效条带,扩增率为66.67％,其中9对引物能扩增出多态性条带,多态性比率为45％.用20对有效引物在欧洲李和天山樱桃中进行扩增,均表现良好的通用性,且同属植物间的通用性明显高于同科植物间,说明引物通用性的高低与基因组的差异有关,亲缘关系越近引物通用性越高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李疆	新疆农业大学林学与园艺学院	209	2704	28.0	40.0
2	罗淑萍	新疆农业大学农学院	152	1655	22.0	30.0
3	盛芳	新疆农业大学林学与园艺学院	6	21	3.0	4.0
4	李鹏	新疆农业大学林学与园艺学院	29	91	5.0	8.0
5	田嘉	新疆农业大学林学与园艺学院	32	104	6.0	8.0
6	秦雪	新疆农业大学林学与园艺学院	3	5	1.0	2.0